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基于23S/5S rDNA序列的柑橘黄龙病病原菌亚洲种系统发育研究

廖惠红;白先进;李杨瑞;陈传武;杨丽涛;朱建华;徐宁;   

  1. 广西大学农学院;广西农业科学院园艺研究所;广西农业科学院;广西柑橘研究所;
  • 出版日期:2009-05-26 发布日期:2009-05-26
  • 基金资助:
    广西壮族自治区人才小高地项目桂发办[2004]47号

  • Published:2009-05-26 Online:2009-05-26

摘要: 根据柑橘黄龙病亚洲种23S/5S的DNA序列设计一对引物对不同地理来源的6个柑橘黄龙病样品DNA进行扩增,扩增片段大小均为1 654 bp包括一个假定细胞壁水解酶假基因(putative cell wall hydrolase pseudogene)和5S rRNA基因。序列同源性分析结果表明;6个柑橘黄龙病病原菌样品与柑橘黄龙病病原菌亚洲种Sihui样品的同源性为99%,然而与土壤杆菌,布鲁氏菌,根瘤菌,中华根瘤菌,巴通体菌和中慢生根瘤菌的同源性只有89%~95%,说明在23S/5S rDNA序列上黄龙病病原菌亚洲种与α变形菌纲根瘤菌目的其他病原菌相差较大。对黄龙病病原菌亚洲种种内的23S/5S rDNA序列进行比较分析,结果发现黄龙病病原菌亚洲种种内之间putative cell wall hydrolase pseudogene和5S rRNA的基因序列非常保守,但不同地理来源的柑橘黄龙病样品碱基序列间确实存在差异,差异的大小与地理的远近无关。利用简约法对黄龙病病原菌亚洲种及α变形菌纲其它病原菌的23S/5S rDNA序列构建的系统发育树显示黄龙病病原菌亚洲种单独聚为一类,其他细菌聚为另一类,该结果与基于rplJ基因及16S rRNA基因的DNA序列构建的分子系统进化树结果一致。

关键词: 柑橘, 黄龙病, 亚洲种, 23S/5S rDNA