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辽东湾斑海豹(Phoca largha)线粒体D-loop区异质型研究初探

高祥刚;孙凡越;李云峰;鹿志创;韩家波;赫崇波;   

  1. 辽宁省海洋水产科学研究院辽宁省海洋水产分子生物学重点实验室;辽宁师范大学生命科学院;
  • 出版日期:2009-06-26 发布日期:2009-06-26
  • 基金资助:
    国家海洋908项目辽宁专项(LN-908-01-01-06);; 辽宁省海洋与渔业科研计划项目(200801)

  • Published:2009-06-26 Online:2009-06-26

摘要: 采用PCR技术和DNA克隆测序技术,随机测定了3头斑海豹mtDNA控制区(D-loop区)CSB-3上、下游1000 bp左右的序列,每头斑海豹任选14个克隆菌斑进行测序,结果所得序列均无重复,得到42个单倍型。结合GenBank已发表的斑海豹mtDNA控制区序列(Phoca largha,AM181031),通过ClustalX1.83、MEGA3.1和FastPCRv3.6等生物信息学软件进行序列比对,发现我国珍稀保护动物斑海豹个体内线粒体DNA(mtDNA)的控制区CSB-3之后存在异质型现象,且存在数目不等的串联重复序列。从分子水平进行了不同类型重复序列变化规律的研究,初探了mtDNA控制区异质型在斑海豹中的存在情况。

关键词: 斑海豹, mtDNA控制区, 串联重复序列, 异质型