]*>","")" /> 三丁基锡暴露条件下杂色鲍肝胰腺均一化cDNA文库的构建

• 论文 • 上一篇    下一篇

三丁基锡暴露条件下杂色鲍肝胰腺均一化cDNA文库的构建

贾锡伟;张子平;邹志华;王艺磊;   

  1. 厦门大学近海海洋环境科学国家重点实验室厦门大学环境科学研究中心;集美大学水产学院福建省高校水产科学技术与食品安全重点实验室;德克萨斯州立大学化学与生物化学系;
  • 出版日期:2009-11-26 发布日期:2009-11-26
  • 基金资助:
    厦门市科技计划项目(3502Z20055024);; 国家自然科学基金(20877034);; 集美大学创新团队基金(2008A001)

  • Published:2009-11-26 Online:2009-11-26

摘要: 用RDP试剂提取三丁基锡暴露诱导的杂色鲍肝胰腺总RNA,经Oligotex纯化得到mRNA;应用SMART技术合成双链cDNA,双链特异核酸酶(DSN)进行双链cDNA的均一化,构建了杂色鲍三丁基锡暴露诱导下的均一化cDNA文库。原始文库的库容为4.3×106CFU/ml,重组率为97.9%。从文库中随机挑选了3288个克隆进行测序,得到3048个高质量EST序列,其中有370条Contigs,2103条Singlets,Unigenes共2473条,冗余率为18.86%。以上结果说明该文库质量较好,为进一步筛选相关功能基因打下基础;较低的冗余率说明该文库值得继续使用大规模ESTs测序的方法寻找相关功能基因,并为进一步使用基因芯片技术研究相关功能基因的表达谱提供便利。

关键词: 三丁基锡, 杂色鲍, 均一化cDNA文库