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河西绒山羊GOLA-DRB1基因第2外显子变异特征分析

王佳泰;王继卿;胡江;马小军;罗玉柱;   

  1. 甘肃农业大学动物科学技术学院;甘肃省草食动物生物技术重点实验室研究测试中心;
  • 出版日期:2011-12-26 发布日期:2011-12-26
  • 基金资助:
    甘肃省教育厅科研项目(0902B-01);;

  • Published:2011-12-26 Online:2011-12-26

摘要: 采用PCR-SSCP、克隆测序等方法,分析600只河西绒山羊GOLA-DRB1基因第2外显子遗传特征、SNPs变异类型,同时分析该基因与山羊流产的关联性。结果表明,河西绒山羊DRB1基因第2外显子上存在26个等位基因,序列比对后发现26个等位基因中存在71个核苷酸变异位点,占分析位点总数的30%。其中转换位点25个,占核苷酸多态位点的35.21%;颠换位点35个,占核苷酸多态位点的49.3%;转换和颠换共存位点9个,占12.68%。山羊流产关联性分析结果表明,在河西绒山羊病例组中DRB1*18、DRB1*23、DRB1*26等位基因频率高于正常对照组(P<0.05),χ2值分别为6.31,4.859,6.396,RR值为2.55,2.72,DRB1*8等位基因频率显著高于正常对照组(P<0.01),χ2值为17.618,RR值为3.59;病例组中DRB1*14等位基因频率低于正常对照组(P<0.05),χ2值为4.812,RR值为0.65,DRB1*1和DRB1*11显著低于正常对照组(P<0.01),其中B1的χ2值和RR值分别为14.11和0.61,初步推断DRB1*8可能是河西绒山羊流产发病单体型中的遗传易感基因,DRB1*1和DRB1*11可能为其遗传保护基因。

关键词: DRB1基因, PCR-SSCP, 流产, 河西绒山羊