长心卡帕藻RAPD-PCR反应体系的正交优化研究

长心卡帕藻RAPD-PCR反应体系的正交优化研究

赵素芬;张婷;应成琦;何培民;

上海水产大学生命科学与技术学院;

出版日期:2008-08-26 发布日期:2008-08-26
基金资助:
上海浦江人才计划项目(05PJ14086);; 上海市教委优势(重点)学科资助项目(Y1101)

Published:2008-08-26 Online:2008-08-26

摘要/Abstract

摘要： 采用SD(S十二烷基硫酸钠,20%)法提取了大型海藻长心卡帕藻(Kappaphycus alvarezii)基因组DNA。通过单因子梯度试验,确定了影响随机扩增DNA多态性(RAPD)扩增结果的模板、Mg2+、dNTPs、S22引物、Taq的适宜浓度、退火温度和反应的最佳循环次数;利用正交试验优化了模板、Mg2+、dNTPs、S22引物、Taq的配比浓度。结果表明,在进行长心卡帕藻的RAPD扩增时,在总体积为25μl的反应体系中,模板、Mg2+、dNTPs、S22引物、Taq的最佳浓度分别为15ng、2.0mmol/L、0.2mmol/L、0.25μmol/L、2.5U;退火温度为37℃。反应程序为94℃预变性5min,然后经94℃变性30s、37℃退火1min,72℃延伸2min,进行30次循环,最后在72℃再延伸10min。

关键词: 长心卡帕藻, DNA提取, 随机扩增DNA多态性, 反应体系

赵素芬;张婷;应成琦;何培民;. 长心卡帕藻RAPD-PCR反应体系的正交优化研究[J]. .

[1]	申恒, 刘思慧, 李跃, 李敬涛, 梁文星. 一种用于PCR的番茄DNA快速粗提方法[J]. 生物技术通报, 2022, 38(6): 74-80.
[2]	张雨函, 范熠, 李婷婷, 庞爽, 刘为, 白可喻, 张西美. 基于宏基因组测序的植物叶表微生物富集及DNA提取方法[J]. 生物技术通报, 2022, 38(3): 256-263.
[3]	杨秀清, 陈彦梅, 吴瑞薇, 王保玉, 韩作颖. 煤地质环境微生物总基因组DNA提取方法的优化[J]. 生物技术通报, 2018, 34(9): 177-183.
[4]	徐雯, 瞿印权, 韩笑, 何天友, 荣俊冬, 郑郁善. 正交设计优化绿竹ISSR-PCR体系和引物筛选[J]. 生物技术通报, 2017, 33(8): 103-110.
[5]	李海洋, 王飞, 雷红涛, 张璇, 陈珂. 硅羟基磁珠的制备及全基因组DNA提取优化[J]. 生物技术通报, 2017, 33(6): 223-229.
[6]	徐宗昌, 王萌, 孔英珍. 烟草碱法提取基因组DNA的改进[J]. 生物技术通报, 2017, 33(2): 59-65.
[7]	张红利,贾鑫磊,刘建霞,张永芳. 保存方式和回软温度对蜜蜂标本DNA提取的影响[J]. 生物技术通报, 2016, 32(7): 250-256.
[8]	周海兰,李绍鹏,李卫亮,贺军虎,包冬红,李茂富. 油梨基因组DNA提取、SSR-PCR反应体系优化及引物筛选[J]. 生物技术通报, 2016, 32(4): 143-150.
[9]	赵玲云, 范东颖, 李燕芳, 颜霞, 黄丽丽. 枝干树皮宏基因组DNA的提取[J]. 生物技术通报, 2016, 32(1): 74-79.
[10]	张振华,鲍王波,余冉,王长永,刘燕. 鹌鹑肠道微生物PCR-DGGE方法的优化[J]. 生物技术通报, 2015, 31(1): 73-78.
[11]	戴恬美, 吕志创, 万方浩. 烟粉虱全基因组DNA四种提取方法的比较[J]. 生物技术通报, 2014, 0(8): 70-75.
[12]	李进波, 盛婧, 李想, 潘良文, 吕蓉, 杨捷琳. 五种DNA提取方法对鱼加工制品DNA提取效果的比较[J]. 生物技术通报, 2014, 0(4): 43-49.
[13]	权俊萍;贾晓鹰;戴丽娜;肖俊辉;田琴;牛攀新;吕国华;. 薰衣草高质量DNA提取及ISSR-PCR多重化体系的建立[J]. , 2012, 0(05): 151-157.
[14]	赖呈纯;范丽华;谢鸿根;余亚白;郑铭西;谢福鑫;. 葡萄ISSR-PCR反应体系的建立与优化[J]. , 2012, 0(02): 159-164.
[15]	武强;吕志创;万方浩;李照会;. 三种提取苹果绵蚜基因组DNA方法的比较[J]. , 2012, 0(01): 70-73.

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