李任峰;田香勤;何启盖;王自良;赵坤;李学斌;王三虎;
摘要： 为了进一步研究猪胸膜肺炎放线杆菌(Actionobacillus pleuropneum oniae,App)ApxIIA基因的结构和功能,选取GenBank中6株不同App分离株,采用生物信息学方法对其ApxIIA基因及其编码氨基酸序列进行同源性比对,并选择其中AY232288.1菌株(湖北分离株)ApxIIA基因为研究对象,分析该基因所编码蛋白质的理化性质,并对其可能形成的二级结构及B细胞表位进行预测和分析。结果表明,6株不同App分离株ApxIIA基因核苷酸及氨基酸序列同源性分别为65.56(和88.42(,在AY232288.1菌株ApxIIA蛋白的肽链中,745~751和801~807区段可能是其B细胞表位优势区。本研究首次利用生物信息学方法对ApxIIA基因及其蛋白质结构进行了分析和预测,为ApxIIA基因功能的深入研究及APP多表位疫苗的设计奠定了基础。
