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四数獐牙菜ISSR-PCR反应体系的正交优化

杨路存;陈桂琛;周国英;宋文珠;李春丽;许璟瑛;   

  1. 中国科学院西北高原生物研究所;中国科学院研究生院;
  • 出版日期:2010-09-26 发布日期:2010-09-26
  • 基金资助:
    国家中西部专项项目(2001BA901A47)

  • Published:2010-09-26 Online:2010-09-26

摘要: 采用正交试验与单因素设计相结合的方法,对四数獐牙菜ISSR-PCR反应体系中的4种主要因素(Mg2+、TaqDNA聚合酶、dNTP及引物)进行优化筛选,PCR结果用统计软件SPSS16.0分析。结果显示,Mg2+、TaqDNA聚合酶、dNTP这3因素的不同水平对PCR反应结果都有显着影响,其中Mg2+的浓度影响最大。筛选出各反应因素的最佳水平,建立四数獐牙菜ISSR-PCR反应的最佳体系(25μL)为3.0 mmol/L Mg2+,250μmol/L dNTP,0.6μmol/L引物,1UTaqDNA聚合酶,40 ngDNA,2.5μL10×buffer。这一体系的建立为今后利用ISSR技术进行四数獐牙菜遗传多样性分析以及物种保护奠定了技术基础。

关键词: 四数獐牙菜, ISSR-PCR, 正交设计, 体系优化