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应用PCR-DGGE技术分析BKS-2型糖尿病模型小鼠盲肠内容物微生物菌群结构

魏婷婷;胡芳;杜彩贺;张仁敏;周东蕊;张红琳;陆祖宏;   

  1. 东南大学学习科学研究中心;东南大学生物科学与医学工程学院;
  • 出版日期:2012-04-26 发布日期:2012-04-26
  • 基金资助:
    江苏省科技支撑计划项目(BE2010675)

  • Published:2012-04-26 Online:2012-04-26

摘要: 通过对BKS-DB 2型糖尿病小鼠盲肠内容物微生物群落结构的分析,探讨基因突变模型鼠肠道微生物群落与糖尿病发生的相关性。提取BKS-DB 2型糖尿病小鼠与同窝对照小鼠盲肠内容物细菌总DNA,PCR扩增16S rRNA基因V3区,DGGE方法检测扩增产物,并挑选特异条带测序,对图谱作UPGAMA聚类分析,运用SPSS软件分析多样性。结果显示,UPGAMA聚类分析表明,对照组样本之间相似度0.66-0.91,糖尿病组样本之间相似度0.61-0.88,两组之间最高相似度为0.51。特异性条带测序后经比对与Parabacteroides菌属亲缘关系最近。SPSS统计分析糖尿病组和健康对照组小鼠的DGGE条带数、多样性指数(H’)、丰富度(R)和优势度(D)的差异性显著,具有统计学意义(P<0.05)。糖尿病组小鼠与对照组小鼠的盲肠内容物微生物群落多样性存在差异,糖尿病对肠道微生物的多样性有影响。

关键词: 2型糖尿病, BKS-DB2小鼠, 盲肠内容物菌群结构, 变性梯度凝胶电泳(DGGE)