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牛RHOQ基因的电子克隆与生物信息学分析

吴晓云;阎萍;梁春年;郭宪;包鹏甲;裴杰;丁学智;褚敏;刘文博;焦斐;刘建;   

  1. 中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所甘肃省牦牛繁育工程重点实验室;
  • 出版日期:2012-06-26 发布日期:2012-06-26
  • 基金资助:
    国家肉牛牦牛产业技术体系(CARS-38);;

  • Published:2012-06-26 Online:2012-06-26

摘要: 利用电子克隆技术获得牛RHOQ基因cDNA序列,采用生物信息学方法对该基因及其编码蛋白的基本理化性质、疏水性、信号肽、二级结构和亚细胞定位等方面进行预测和分析。结果表明,牛RHOQ基因的cDNA序列全长1 517 bp,包含1个618 bp开放阅读框,编码205个氨基酸;其编码蛋白属疏水性蛋白,不存在信号肽及跨膜结构,定位于分泌系统囊泡;二级结构主要以无规则卷曲和α-螺旋为主。牛RHOQ基因编码蛋白可能具有生长因子功能,可能在神经再生和突触延伸过程中起重要作用。

关键词: 牛, RHOQ基因, 电子克隆, 生物信息学分析