美丽硬仆骨舌鱼mtDNA D-loop区遗传变异特征

美丽硬仆骨舌鱼mtDNA D-loop区遗传变异特征

牟希东;宋红梅;汪学杰;杨叶欣;罗渡;顾党恩;罗建仁;胡隐昌;

中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室;

出版日期:2012-09-26 发布日期:2012-09-26
基金资助:
国家科技基础条件平台子项目;;

Published:2012-09-26 Online:2012-09-26

摘要/Abstract

摘要： 采用直接测序法分析美丽硬仆骨舌鱼(Scleropages formosus)3个种群(金龙鱼、红龙鱼和青龙鱼)共24个个体的线粒体D-loop区的遗传变异特征。经序列比对、分析,金龙鱼、红龙鱼和青龙鱼的D-loop序列不仅在个体间存在位点序列的变异(17个简约性信息位点),而且还存在序列长度的多态性(长度为915-924 bp),这种长度的差异在于存在不同碱基长度的微卫星序列。3种龙鱼碱基组成基本一致,G含量偏低。定义了10种单倍型,但金龙鱼、红龙鱼和青龙鱼间没有共享单倍型,单倍型多样度较高(0.667-1.00),核苷酸多样度较低(0.001 09-0.003 23)。AMOVA分析显示,变异主要来自地理区内不同群体间,个体间遗传距离为0-0.008 7,显示遗传变异仍处于种内水平。NJ、MP和Bayesian构建的分子系统树拓扑结构基本一致,但不能有效地反映金龙鱼、红龙鱼和青龙鱼间的亲缘关系。

关键词: 美丽硬仆骨舌鱼, mtDNA, D-loop, 遗传变异

牟希东;宋红梅;汪学杰;杨叶欣;罗渡;顾党恩;罗建仁;胡隐昌;. 美丽硬仆骨舌鱼mtDNA D-loop区遗传变异特征[J]. .

[1]	张道磊, 甘雨军, 乐亮, 普莉. 玉米产量性状的表观遗传调控机制和育种应用[J]. 生物技术通报, 2023, 39(8): 31-42.
[2]	李晓凯, 范一星, 乔贤, 张磊, 王凤红, 王志英, 王瑞军, 张燕军, 刘志红, 王志新, 何利兵, 李金泉, 苏蕊, 张家新. 山羊基因组与遗传变异图谱研究进展[J]. 生物技术通报, 2020, 36(4): 175-184.
[3]	李晓凯 ,王贵 ,乔贤 ,范一星 ,张磊 ,马宇浩 ,聂瑞雪 ,王瑞军 ,何利兵 ,苏蕊. 全基因组测序在重要家畜上的研究进展[J]. 生物技术通报, 2018, 34(6): 11-21.
[4]	戴习林, 高翔, 王海洋, 明磊, 江宗冰, 丁福江. 幼体发育速度不同的罗氏沼虾遗传结构分析[J]. 生物技术通报, 2016, 32(2): 192-197.
[5]	郭永博, 蔡原. 西藏藏猪遗传多样性研究[J]. 生物技术通报, 2015, 31(5): 224-230.
[6]	梁春花, 刘霞, 孙雪婧, 罗玉柱 ,高雪晋, 杜晓华. 甘肃河西地区西门塔尔杂交类群NGB基因第3外显子的遗传变异研究[J]. 生物技术通报, 2015, 31(2): 122-128.
[7]	丁玫, 陈祥, 许厚强, 吴通贵, 冯文武, 柏琳. 贵州三个地方猪种的系统发育分析[J]. 生物技术通报, 2014, 0(4): 96-101.
[8]	牛京京;张守纯;金谷;于宁;. 线粒体基因及其Cyt b基因与昆虫分子系统学研究[J]. , 2011, 0(04): 52-55.
[9]	陈四海;区又君;李加儿;. 鱼类线粒体DNA及其研究进展[J]. , 2011, 0(03): 13-20.
[10]	强承魁;杜予州;凤舞剑;王胜永;周保亚;胡忍;崔亚东;. 不同昆虫泛素基因部分序列的生物信息学分析[J]. , 2010, 0(10): 188-192.
[11]	张根发;. 遗传变异分析实验指南[J]. , 2010, 0(07): 77-77.
[12]	高祥刚;孙凡越;李云峰;鹿志创;韩家波;赫崇波;. 辽东湾斑海豹(Phoca largha)线粒体D-loop区异质型研究初探[J]. , 2009, 0(S1): 248-261.
[13]	李伟丰;唐侃;王湛军;唐绍清;. 基于线粒体DNA序列的广西蜜柑大实蝇与日本蜜柑大实蝇的比较研究[J]. , 2009, 0(S1): 320-325.
[14]	张桂香;王志刚;樊睿;郑友民;刘丑生;韩旭;昝林森;齐国强;. 我国水牛地方品种线粒体D-loop区遗传变异与起源分化[J]. , 2009, 0(04): 107-111.
[15]	秦春圃. 南阳黄牛mtDNA D-100p序列多态性分析结果[J]. , 2005, 0(01): 60-61.

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