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羊流产嗜衣原体ompA基因克隆及生物信息学分析

龙冲冲;江楠;彭中友;龙胜基;罗意;周碧君;文明;   

  1. 贵州大学动物科学学院;华南农业大学动物科学学院;贵州大学精细化工研究开发中心;贵州省动物疫病研究室;
  • 出版日期:2012-08-26 发布日期:2012-08-26
  • 基金资助:
    贵州省农业攻关项目(黔科合NY字[2011]3105号);;

  • Published:2012-08-26 Online:2012-08-26

摘要: 分析羊流产嗜衣原体ompA基因结构并预测其编码蛋白的结构和功能。采用DNA Star、DNA MAN、vector NTI suite11.5序列分析软件和在线网站ExPASy分析该基因的结构和预测其编码蛋白的理化性质、亚细胞定位、一级结构修饰位点、二级结构特征及三维空间构象、潜在抗原表位等。结果显示,该基因全长1 170 bp,可编码389个氨基酸,编码蛋白理化性质较稳定,无各种亚细胞定位序列,含有多个能被其他酶修饰的位点,该蛋白以无规则卷曲为主,大部分氨基酸残基包埋在分子内部,含5个跨膜区,3个亲水性较强的抗原表位。ompA基因生物信息学分析结果为ompA蛋白功能的深入研究和新型多价疫苗的开发提供了基础数据。

关键词: 羊流产嗜衣原体, ompA基因, 生物信息学分析