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芯片杂交中荧光标记样品定量与非定量的比较研究

冯春琼;马文丽;李凌;宋艳斌;石嵘;吴清华;郭秋野;郑文岭   

  1. 第一军医大学分子生物学研究所,第一军医大学分子生物学研究所,第一军医大学分子生物学研究所,第一军医大学分子生物学研究所,第一军医大学分子生物学研究所,第一军医大学分子生物学研究所,第一军医大学分子生物学研究所,广州军区总医院分子肿瘤学研究所 广州510515
  • 出版日期:2002-12-26 发布日期:2002-12-26

  • Published:2002-12-26 Online:2002-12-26

摘要: 比较在芯片杂交中 ,荧光标记样品定量与非定量对杂交结果的影响。其方法是 ,提取经As2 O3 作用K5 6 2细胞前后的总RNA ,逆转录成cDNA第一链 ,并分别用Cy3/Cy5标记。标记后的样品再次定量或不定量 ,但均取相同体积上样与K5 6 2芯片杂交 ,用扫描仪扫描并分析。其结果 ,标记后样品定量与不定量杂交的结果都与理论推测一致 ,但以样品定量进行杂交的效果更好 ,标记样品杂交前再次定量的 ,分析发现 2个基因表达下调 ;杂交前不定量仅取相同体积进行杂交的 ,发现 6个基因片段表达下调 ,其中只有 2个基因与细胞凋亡通路密切相关。认为在芯片的杂交检测中 ,对荧光标记样品杂交前再次定量可大大提高杂交结果的可靠性。

关键词: 芯片, 定量检测, As2O3, K562细胞