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猪源冠状病毒TGEV中国分离株纤突蛋白生物信息学分析

李建强;柳纪省;程杰;兰喜;殷相平;李宝玉;李学瑞;杨彬;娄忠子;吴润;   

  1. 中国农业科学院兰州兽医研究所家畜疫病病原生物学国家重点实验室农业部畜禽病毒学重点开放实验室;甘肃农业大学动物医学院;
  • 出版日期:2009-04-26 发布日期:2009-04-26
  • 基金资助:
    重大基础研究“973”前期研究专项(2004CCA00500)

  • Published:2009-04-26 Online:2009-04-26

摘要: 以猪源冠状病毒(Porcine coronavirus)TGEV纤突蛋白基因序列为基础,利用生物软件对TGEV中国分离株纤突蛋白进行N-糖基化位点、跨膜螺旋、进化树、二级结构及抗原位点的预测和分析。结果显示所有TGEV毒株可分为3个基因型,4株中国分离株分别归属于以上3个基因型,属于Ⅰ型的中国株TSX在跨膜螺旋的氨基酸及二级结构上与其他中国株有明显的差异,而同属于Ⅲ型中国毒株SC-Y和TH-98在跨膜螺旋的氨基酸及二级结构上非常接近,而所有中国分离株抗原表位没有明显差别,表明TGEV在中国没有显着的变异。

关键词: 猪源冠状病毒, 猪传染性胃肠炎, 纤突蛋白, 生物信息学分析