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斯达氏油脂酵母肌动蛋白基因克隆及序列分析

唐伟;谭海东;张素芳;赵宗保;   

  1. 中国科学院大连化学物理研究所;中国科学院研究生院;
  • 出版日期:2009-06-26 发布日期:2009-06-26
  • 基金资助:
    国家863计划(2007AA05Z403);; 中国科学院知识创新工程重要方向项目(KGCX2-YW-336)

  • Published:2009-06-26 Online:2009-06-26

摘要: 以产油真菌斯达氏油脂酵母(Lipomyces starkeyi AS 2.1560)为材料,提取总RNA,反转录成cDNA。根据真菌肌动蛋白(actin)保守核酸序列设计引物,PCR扩增后获得部分序列,再采用cDNA末端快速扩增技术获得了开放阅读框全长为1128 bp的cDNA序列,该序列编码蛋白质含375个氨基酸残基,等电点为5.49。同源性比较发现该基因(Accession No. EU258762)与其它已知真菌的actin基因相似性在75%以上,氨基酸序列相似性在90%以上。通过不同物种肌动蛋白进化树分析发现L.starkeyi与亚罗解脂酵母(Yarrowia lipolytica)有较近的素缘关系。该研究对探索L.starkeyi产油机制有一定的参考价值。

关键词: 斯达氏油脂酵母, 肌动蛋白, RNA提取, RACE, 系统进化树