甘蓝型油菜β碳酸酐酶的结构预测

甘蓝型油菜β碳酸酐酶的结构预测

邓秋红;栗茂腾;向福;余龙江;

华中科技大学生命科学与技术学院;

出版日期:2010-01-26 发布日期:2010-01-26
基金资助:
国家重点基础研究发展计划(2006CB403301);; 国家“863”高技术计划(2009AA101105)

Published:2010-01-26 Online:2010-01-26

摘要/Abstract

摘要： 根据已经克隆到的甘蓝型油菜β碳酸酐酶基因序列,概念地翻译成蛋白质的氨基酸序列。利用Vector NTISuite、SOPMA、Swiss-Model和NCBI-VAST等软件和服务器对甘蓝型油菜β碳酸酐酶的一级结构、二级结构、三维结构进行分子结构模型预测,并进行三维结构的比对。预测结果显示,甘蓝型油菜β碳酸酐酶是定位于叶绿体基质的蛋白质,具有β类碳酸酐酶所特有的保守性基序Cys-Xn-His-X2-Cys;SOPMA预测二级结构显示α螺旋(39.88%)、随机卷曲(39.27%)、β折叠(16.31%)和β转角(4.53%);用同源建模法构建了三维结构图;通过VAST矢量比对工具将甘蓝型油菜β碳酸酐酶与模板(1ekjG)进行三维结构比对,显示甘蓝型油菜β碳酸酐酶与豌豆β碳酸酐酶同型八聚体中的一个单体(1ekjG)很好的匹配,推测甘蓝型油菜β碳酸酐酶全酶也是同型八聚体。

关键词: 甘蓝型油菜, 碳酸酐酶, 分子结构, 结构预测, 结构比对

邓秋红;栗茂腾;向福;余龙江;. 甘蓝型油菜β碳酸酐酶的结构预测[J]. .

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