甘蔗液泡ATP酶C亚基基因克隆及序列分析

甘蔗液泡ATP酶C亚基基因克隆及序列分析

许志宇;王俊刚;杨本鹏;张树珍;

中国热带农业科学院热带生物技术研究所农业部热带生物技术重点开放实验室;海南大学农学院;

出版日期:2010-09-26 发布日期:2010-09-26
基金资助:
现代农业产业技术体系建设专项资金(nycytx-24);; 国家自然科学基金(30560081);; 中央级公益科研院所基本科研业务费(ITBBZD1022);; 农业部“948”项目(2010-C21)

Published:2010-09-26 Online:2010-09-26

摘要/Abstract

摘要： 根据筛选文库时获得的EST序列信息,利用RACE技术分离了一个甘蔗ATP酶C亚基基因,命名为ShVHA-C。该基因cDNA全长1 312 bp,含有1 056 bp的完整阅读框架,编码351个氨基酸。序列比对及结构预测分析表明,ShVHA-C编码的氨基酸序列与水稻、小麦、苜蓿、绿豆和蓖麻中相应基因氨基酸序列的一致性分别达到94.10%、93.22%、91.15%、91.15%和91.74%,与水稻一致性最高。在整个二级结构中,含有233个α-螺旋(alpha helix),占66.38%;含有5个延伸链(extended strand),占1.42%;含有113个无规则卷曲(random coil),占32.19%。此蛋白不具有导肽。整个多肽链表现为亲水性,没有明显的疏水区域,初步认为甘蔗ShVHA-C编码蛋白是亲水性蛋白。

关键词: 甘蔗, 糖分积累, V-ATPase, RACE, 序列分析

许志宇;王俊刚;杨本鹏;张树珍;. 甘蔗液泡ATP酶C亚基基因克隆及序列分析[J]. .

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