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文蛤胞内铜锌超氧化物歧化酶基因的克隆与序列分析

朱丹;李宏俊;高祥刚;苏浩;赫崇波;   

  1. 辽宁师范大学生命科学学院;辽宁省海洋水产科学研究院辽宁省海洋水产分子生物学重点实验室;
  • 出版日期:2010-11-26 发布日期:2010-11-26
  • 基金资助:
    辽宁省科学技术计划重大、重点项目(2008203001);; 辽宁省海洋与渔业科研计划项目(200801);; 国家海洋公益性行业科技专项(200805037)

  • Published:2010-11-26 Online:2010-11-26

摘要: 文蛤(Meretrix meretrix)是我国重要的滩涂养殖贝类之一,由于病害等原因,特别是红肉病的蔓延,文蛤增养殖业的发展受到严重制约。铜锌超氧化物歧化酶(Cu/Zn-SOD)是活性氧清除酶系中最重要的酶,在生物体内参与清除氧自由基,防御分子损伤和机体衰老等诸多生物事件。通过构建SMART全长cDNA文库和RACE的方法,克隆得到了文蛤胞内Cu/Zn-SOD(icCu/Zn-SOD)的全长cDNA序列。生物学软件分析表明,该序列全长为1383bp,5′UTR为45bp,3′UTR为876bp,开放阅读框长度为462bp,编码153个氨基酸,Cu原子分别与His46、His48、His63、His119配位,Zn则与His63、His71、His80和Asp83配位,半胱氨酸Cys57和Cys145之间形成唯一的链内二硫键。蛋白质结构中心是由8条反向平行的β折叠围成的圆桶状结构。文蛤icCu/Zn-SOD与紫贻贝等其它9种海洋贝类的Cu/Zn-SOD具有较高的同源性。

关键词: 文蛤, 铜锌超氧化物歧化酶, 表达序列标签, cDNA文库