生物技术通报 ›› 2016, Vol. 32 ›› Issue (12): 103-107.
肖晶1,查星琴1,2,成文敏1,2,霍金龙1,2,潘伟荣1,2,王淑燕1,2,王配1,2,刘海京2,张秀琼2,曾养志2
XIAO Jing1,ZHA Xing-qin1,2,CHENG Wen-min1,2,HUO Jin-long1,2,PAN Wei-rong1,2,WANG Shu-yan1,2,WANG Pei1,2,LIU Hai-jing2,ZHANG Xiu-qiong2,ZENG Yang-zhi2
摘要: 获得版纳微型猪近交系(BMI)CATSPER3基因部分编码区序列,通过生物信息学分析其氨基酸序列和进行不同物种间的同源性比较。以版纳微型猪近交系的公猪睾丸为材料提取RNA,RT-PCR方法扩增CATSPER3基因部分编码区序列,利用在线分析软件进行生物信息学分析。结果显示,扩增出CATSPER3基因部分编码区序列。生物信息学分析表明,推导氨基酸序列,编码蛋白分子量为19.397 3 kD,理论等电点为5.05;在氨基酸组成上,酸性氨基酸(Asp+Glu)有24个、碱性氨基酸(Lys+Arg)有16个,其中以亮氨酸(Leu)占13.3%、缬氨酸(Val)占9.6%、苏氨酸(Thr)占9.0%、苯丙氨酸(Phe)占8.4%、谷氨酸(Glu)占7.2%,天冬氨酸(Asp)占7.2%等含量较高。在核苷酸相似度上与普通猪相似度最高,与山羊核苷酸的相似度较低;分子系统进化树表明与非近交系猪同处于一个分支中,亲缘关系较近,与山羊和绵羊亲缘关系较远。
中图分类号: