松江鲈(Trachidermus fasciatus)凝血因子XI的基因克隆与表达分析

doi:10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2015.04.029

生物技术通报 ›› 2015, Vol. 31 ›› Issue (3): 199-206.doi: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2015.04.029

松江鲈(Trachidermus fasciatus)凝血因子XI的基因克隆与表达分析

齐琪, 亓云月, 杨慧, 毕彩红, 韩晓弟,

(山东大学，威海 264209)

收稿日期:2014-08-26 出版日期:2015-03-16 发布日期:2015-03-16
作者简介:齐琪，研究方向：鱼类免疫；E-mail：530287931@qq.com
基金资助:
威海市科委项目(1070432121313)

Songjiang Sea Bass(Trachidermus fasciatus)Analysis of Gene Cloning and Expression of Coagulation Factor XI

Qi Qi Qi Yunyue Yang Hui Bi Caihong Han Xiaodi

(Shandong University, Weihai 264209)

Received:2014-08-26 Published:2015-03-16 Online:2015-03-16

摘要/Abstract

摘要： 克隆松江鲈凝血因子XI基因cDNA序列，分析表达模式。利用RACE 技术从松江鲈中克隆获得了凝血因子XI的cDNA全长序列(命名为TfXI)，并对其进行生物信息学和表达模式分析。获得TfXI cDNA全长1 287 bp，包括13 bp 的5'端非编码区，1 143 bp的开放阅读框以及131 bp 的3'端非编码区。开放阅读框编码280个氨基酸的多肽链，预测的蛋白大小为42.9 kD。N端含有由第22-105位氨基酸，112-196位氨基酸、205-279位氨基酸和289-369位氨基酸形成的4个串联排列的典型APPLE结构域。NCBI Blast结果显示TfXI与其他物种凝血因子XI的相似性为30%-63%，进化树分析显示，TfXI符合传统进化规律。Real time PCR分析表明，经LPS刺激96 h后，松江鲈脾脏TfXI表达量明显提高(P< 0.01)。

关键词: 松江鲈, 凝血因子XI, 基因克隆, Real time PCR

Abstract: It was to clone the full length cDNA encoding coagulation factor XI(FXI)of Trachidermus fasciatus. A TfXI gene from Trachidermus fasciatus(TfXI)was cloned and characterized by RACE technology. The TfXI cDNA composed of 1 287 bp with a 13 bp of 5'-UTR, 1 143 bp open reading frame(ORF)and 131 bp 3'-UTR, encoded a polypeptide of 280 amino acids. Sequence alignment of TfXI showed the highest similarity of 63% with Haplochromis burtoni FXI protein. After LPS stimulation, transcripts of TfXI were significantly increased and reached to peak at 96 h p.i. It indicated that TfXI may play an important role in immune response of T. fasciatus during pathogen challenge.

Key words: Trachidermus fasciatus, coagulation factor XI, cloning, real time PCR

齐琪, 亓云月, 杨慧, 毕彩红, 韩晓弟,. 松江鲈(Trachidermus fasciatus)凝血因子XI的基因克隆与表达分析[J]. 生物技术通报, 2015, 31(3): 199-206.

Qi Qi, Qi Yunyue, Yang Hui, Bi Caihong, Han Xiaodi. Songjiang Sea Bass(Trachidermus fasciatus)Analysis of Gene Cloning and Expression of Coagulation Factor XI[J]. Biotechnology Bulletin, 2015, 31(3): 199-206.

参考文献

[1] 武文漫. 遗传性凝血因子XI缺陷的分子发病机制研究进展[J]. 血栓与止血学, 2004, 04：181-184.
[2] Emsley J, McEwan PA, Gailani D. Structure and function of factor XI[J]. Blood, 2010, 115：2569-2577.
[3] Wang X, Smith PL, Hsu MY. Effects of factor XI deficiency on ferric chloride-induced vena cava thrombosis in mice[J]. J Thromb Haemost, 2006, 4(9)：1982-1988.
[4] 东天, 谢岩, 孙东晓, 等. 中国荷斯坦牛凝血因子XI缺陷症遗传分析[J]. 中国奶牛, 2011, (22). 27-29.
[5] Ghanem ME, Nishibori M, Nakao T. Factor XI mutation in a Holstein cow with repeat breeding in Japan[J]. Vet Med Sci, 2005, 67(7)：713-715.
[6] Sinha D, Marcinkiewicz M, Gailani D, Walsh PN. Molecular cloning and biochemical characterization of rabbit factor XI[J]. The Biochemical Journal, 2002, 367：49-56.
[7] Jiang Y, Doolittle RF. The evolution of vertebrate blood coagulation as viewed from a comparison of puffer fish and sea squirt genomes[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2003, 100：7527-7532.
[8] Seligsohn U. Factor XI in haemostasis and thrombosis：past, present and future[J]. Thromb Haemost, 2007, 98(1)：84-89.
[9] Gailani D, Smith SB. Structural and functional features of factor XI[J]. J Thromb Haemost, 2009, 7, suppl(1)：75-78.
[10] Ponczek MB, Gailani D, Doolittle RF. Evolution of the contact phase of vertebrate blood coagulation[J]. J Thromb Haemost, 2008, 6：1876-1883.
[11] Sainz IM1, Pixley RA, Colman RW. Fifty years of research on the plasma kallikrein-kinin system：from protein structure and function to cell biologyand in vivo pathophysiology[J]. Thromb Haemost, 2007, 98(1)：77-83.
[12] Emsley J, McEwan PA, Gailani D. Structure and function of factor XI[J]. Blood, 2010, 115：2569-2577.
[13] 黄左安. 香鱼凝血因子X基因表达与鳗利斯顿氏菌感染的相关性[J]. 动物学研究, 2011(5)：492-498.

[1]	吕秋谕, 孙培媛, 冉彬, 王佳蕊, 陈庆富, 李洪有. 苦荞转录因子基因FtbHLH3的克隆、亚细胞定位及表达分析[J]. 生物技术通报, 2023, 39(8): 194-203.
[2]	王佳蕊, 孙培媛, 柯瑾, 冉彬, 李洪有. 苦荞糖基转移酶基因FtUGT143的克隆及表达分析[J]. 生物技术通报, 2023, 39(8): 204-212.
[3]	孙明慧, 吴琼, 刘丹丹, 焦小雨, 王文杰. 茶树CsTMFs的克隆与表达分析[J]. 生物技术通报, 2023, 39(7): 151-159.
[4]	刘思佳, 王浩楠, 付宇辰, 闫文欣, 胡增辉, 冷平生. ‘西伯利亚’百合LiCMK基因克隆及功能分析[J]. 生物技术通报, 2023, 39(3): 196-205.
[5]	杨旭妍, 赵爽, 马天意, 白玉, 王玉书. 三个甘蓝WRKY基因的克隆及其对非生物胁迫的表达[J]. 生物技术通报, 2023, 39(11): 261-269.
[6]	侯瑞泽, 鲍悦, 陈启亮, 毛桂玲, 韦博霖, 侯雷平, 李梅兰. 普通白菜PRR5的克隆、表达及功能验证[J]. 生物技术通报, 2023, 39(10): 128-135.
[7]	杨敏, 龙雨青, 曾娟, 曾梅, 周新茹, 王玲, 付学森, 周日宝, 刘湘丹. 灰毡毛忍冬UGTPg17、UGTPg36基因克隆及功能研究[J]. 生物技术通报, 2023, 39(10): 256-267.
[8]	李秀青, 胡子曜, 雷建峰, 代培红, 刘超, 邓嘉辉, 刘敏, 孙玲, 刘晓东, 李月. 棉花黄萎病抗性相关基因GhTIFY9的克隆与功能分析[J]. 生物技术通报, 2022, 38(8): 127-134.
[9]	王楠, 张瑞, 潘阳阳, 何翃宏, 王靖雷, 崔燕, 余四九. 牦牛TGF-β1基因克隆及在雌性生殖系统主要器官中的表达定位[J]. 生物技术通报, 2022, 38(6): 279-290.
[10]	李洋, 张晓天, 朴静子, 周如军, 李自博, 关海雯. 花生疮痂病菌蓝光受体EaWC 1基因克隆及生物信息学分析[J]. 生物技术通报, 2022, 38(5): 93-99.
[11]	胡琪, 侯玉翔, 李璿, 李梅兰. 普通白菜CYP79B2同源基因的克隆与表达[J]. 生物技术通报, 2022, 38(12): 168-174.
[12]	甘诚燕, 张心慧, 王沙, 樊瑶羽薇, 招雪晴, 苑兆和. 石榴花发育相关基因PgSPL2的克隆及功能研究[J]. 生物技术通报, 2022, 38(12): 194-203.
[13]	盛雪晴, 赵楠, 林亚秋, 陈定双, 王瑞龙, 李傲, 王永, 李艳艳. 山羊ZNF32的克隆及表达分析[J]. 生物技术通报, 2022, 38(12): 300-311.
[14]	付伟杰, 邝杰华, 罗君, 黄建盛, 陈有铭, 陈刚. 杉虎斑Galectin-8基因克隆及其在不同阿魏酸水平饲料下的表达响应[J]. 生物技术通报, 2022, 38(12): 312-323.
[15]	张琳, 魏祯祯, 宋程威, 郭丽丽, 郭琪, 侯小改, 王华芳. ‘凤丹’牡丹PoFD基因克隆及表达分析[J]. 生物技术通报, 2022, 38(11): 104-111.

松江鲈(Trachidermus fasciatus)凝血因子XI的基因克隆与表达分析

Songjiang Sea Bass(Trachidermus fasciatus)Analysis of Gene Cloning and Expression of Coagulation Factor XI

PDF (PC)

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价