]*>","")" /> 狂犬病病毒CVS株糖蛋白、核蛋白生物信息学分析

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狂犬病病毒CVS株糖蛋白、核蛋白生物信息学分析

李江涛;殷相平;张金卫;丁农;柳纪省;   

  1. 湖州市农业科学研究院;中国农业科学院兰州兽医研究所家畜疫病病原生物学国家重点实验室农业部畜禽病毒学重点开放实验室农业部草食动物疫病重点开放实验室;
  • 出版日期:2010-07-26 发布日期:2010-07-26
  • 基金资助:
    湖州市科技计划项目(2009YN03)

  • Published:2010-07-26 Online:2010-07-26

摘要: 对狂犬病毒(rabies virus,RV)CVS株糖蛋白、核蛋白基因进行了克隆与测序,推导出相应的氨基酸序列。后采用Gamier-Robson方法和Chou-Fasman方法预测了蛋白的二级结构,用Kyte-Doolittle方法对蛋白的亲水性进行了分析,用Emi-ni方法预测了蛋白的表面可能性,以Jameson-Wolf方法预测了蛋白的抗原指数;综合分析预测蛋白的B细胞抗原表位。结果表明,糖蛋白在序列的121-126、133-137、161-165、191-193、201-204、214-216、221-225、264-267区域,核蛋白在序列的143-152、166-172、263-273、411-427区域或其附近最有可能是B细胞抗原表位的优势区域。

关键词: 狂犬病毒, 糖蛋白, 核蛋白, 二级结构, B细胞表位