Biotechnology Bulletin ›› 2021, Vol. 37 ›› Issue (1): 189-197.doi: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2020-0416
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WANG Yan-li(), YANG Yi-ming, FAN Shu-tian, ZHAO Ying, XU Pei-lei, LU Wen-peng(), LI Chang-yu
Received:
2020-04-13
Online:
2021-01-26
Published:
2021-01-15
Contact:
LU Wen-peng
E-mail:524467014@qq.com;182104074@qq.com
WANG Yan-li, YANG Yi-ming, FAN Shu-tian, ZHAO Ying, XU Pei-lei, LU Wen-peng, LI Chang-yu. Genetic Diversity Analysis of 73 Vitis amurensis and Its Hybrids Offsprings Based on SSR Molecular Markers[J]. Biotechnology Bulletin, 2021, 37(1): 189-197.
编号 | 名称 | 采集地 | 种质类型 | 种属 |
---|---|---|---|---|
1 | 双庆 | 中国农业科学院特产研究所 | 选育品种 | 山葡萄 |
2 | 双优 | 中国农业科学院特产研究所 | 选育品种 | 山葡萄 |
3 | 双红 | 中国农业科学院特产研究所 | 选育品种 | 山葡萄 |
4 | 双丰 | 中国农业科学院特产研究所 | 选育品种 | 山葡萄 |
5 | 北国红 | 中国农业科学院特产研究所 | 选育品种 | 山葡萄 |
6 | 北国蓝 | 中国农业科学院特产研究所 | 选育品种 | 山葡萄 |
7 | 北冰红 | 中国农业科学院特产研究所 | 选育品种 | 山欧杂种 |
8 | 左红一 | 中国农业科学院特产研究所 | 选育品种 | 山葡萄 |
9 | 左山二 | 中国农业科学院特产研究所 | 选育品种 | 山葡萄 |
10 | 哈桑 | 中国农业科学院特产研究所 | 俄罗斯引种 | 山欧杂交种 |
11 | 东24-13-1 | 中国农业科学院特产研究所 | 选育品种 | 美洲种 |
12 | RS1201 | 全俄瓦维洛夫作物科学研究远东实验站 | 俄罗斯品种 | 俄罗斯品种 |
13 | RS1202 | 全俄瓦维洛夫作物科学研究远东实验站 | 俄罗斯品种 | 俄罗斯品种 |
14 | RS1203 | 全俄瓦维洛夫作物科学研究远东实验站 | 俄罗斯品种 | 俄罗斯品种 |
15 | RS1204 | 全俄瓦维洛夫作物科学研究远东实验站 | 俄罗斯品种 | 俄罗斯品种 |
16 | RS1401 | 全俄瓦维洛夫作物科学研究远东实验站 | 俄罗斯品种 | 俄罗斯品种 |
17 | RS1402 | 全俄瓦维洛夫作物科学研究远东实验站 | 俄罗斯品种 | 欧山杂种 |
18 | RS1403 | 全俄瓦维洛夫作物科学研究远东实验站 | 俄罗斯品种 | 俄罗斯品种 |
19 | RS1404 | 全俄瓦维洛夫作物科学研究远东实验站 | 俄罗斯品种 | 欧山杂种 |
20 | RS1405 | 全俄瓦维洛夫作物科学研究远东实验站 | 俄罗斯品种 | 欧山美杂种 |
21 | RS1406 | 全俄瓦维洛夫作物科学研究远东实验站 | 俄罗斯品种 | 俄罗斯品种 |
22 | RS1407 | 全俄瓦维洛夫作物科学研究远东实验站 | 俄罗斯品种 | 俄罗斯品种 |
23 | RS1408 | 全俄瓦维洛夫作物科学研究远东实验站 | 俄罗斯品种 | 俄罗斯品种 |
24 | RS1409 | 全俄瓦维洛夫作物科学研究远东实验站 | 俄罗斯品种 | 俄罗斯品种 |
25 | RS1410 | 全俄瓦维洛夫作物科学研究远东实验站 | 俄罗斯品种 | 俄罗斯品种 |
26 | RS1509 | 全俄瓦维洛夫作物科学研究远东实验站 | 俄罗斯品种 | 欧山杂种 |
27 | RS1511 | 全俄瓦维洛夫作物科学研究远东实验站 | 俄罗斯品种 | 欧亚种 |
28 | RS1801 | 俄罗斯海参崴 | 俄罗斯野生资源 | 山葡萄 |
29 | RS1802 | 俄罗斯海参崴 | 俄罗斯野生资源 | 山葡萄 |
30 | RS1803 | 俄罗斯海参崴 | 俄罗斯野生资源 | 山葡萄 |
60 | RS1835 | 俄罗斯海参崴 | 俄罗斯野生资源 | 山葡萄 |
61 | RS1836 | 俄罗斯海参崴 | 俄罗斯野生资源 | 山葡萄 |
62 | RS1837 | 俄罗斯海参崴 | 俄罗斯野生资源 | 山葡萄 |
63 | RS1838 | 俄罗斯海参崴 | 俄罗斯野生资源 | 山葡萄 |
64 | RS1839 | 俄罗斯海参崴 | 俄罗斯野生资源 | 山葡萄 |
65 | RS1840 | 俄罗斯海参崴 | 俄罗斯野生资源 | 山葡萄 |
66 | RS1841 | 俄罗斯海参崴 | 俄罗斯野生资源 | 山葡萄 |
67 | RS1843 | 俄罗斯海参崴 | 俄罗斯野生资源 | 山葡萄 |
68 | RS1844 | 俄罗斯海参崴 | 俄罗斯野生资源 | 山葡萄 |
69 | RS1845 | 俄罗斯海参崴 | 俄罗斯野生资源 | 山葡萄 |
70 | RS1848 | 俄罗斯海参崴 | 俄罗斯野生资源 | 山葡萄 |
71 | RS1849 | 俄罗斯海参崴 | 俄罗斯野生资源 | 山葡萄 |
72 | RS1850 | 俄罗斯海参崴 | 俄罗斯野生资源 | 山葡萄 |
73 | RS1851 | 俄罗斯海参崴 | 俄罗斯野生资源 | 山葡萄 |
编号 | 名称 | 采集地 | 种质类型 | 种属 |
---|---|---|---|---|
1 | 双庆 | 中国农业科学院特产研究所 | 选育品种 | 山葡萄 |
2 | 双优 | 中国农业科学院特产研究所 | 选育品种 | 山葡萄 |
3 | 双红 | 中国农业科学院特产研究所 | 选育品种 | 山葡萄 |
4 | 双丰 | 中国农业科学院特产研究所 | 选育品种 | 山葡萄 |
5 | 北国红 | 中国农业科学院特产研究所 | 选育品种 | 山葡萄 |
6 | 北国蓝 | 中国农业科学院特产研究所 | 选育品种 | 山葡萄 |
7 | 北冰红 | 中国农业科学院特产研究所 | 选育品种 | 山欧杂种 |
8 | 左红一 | 中国农业科学院特产研究所 | 选育品种 | 山葡萄 |
9 | 左山二 | 中国农业科学院特产研究所 | 选育品种 | 山葡萄 |
10 | 哈桑 | 中国农业科学院特产研究所 | 俄罗斯引种 | 山欧杂交种 |
11 | 东24-13-1 | 中国农业科学院特产研究所 | 选育品种 | 美洲种 |
12 | RS1201 | 全俄瓦维洛夫作物科学研究远东实验站 | 俄罗斯品种 | 俄罗斯品种 |
13 | RS1202 | 全俄瓦维洛夫作物科学研究远东实验站 | 俄罗斯品种 | 俄罗斯品种 |
14 | RS1203 | 全俄瓦维洛夫作物科学研究远东实验站 | 俄罗斯品种 | 俄罗斯品种 |
15 | RS1204 | 全俄瓦维洛夫作物科学研究远东实验站 | 俄罗斯品种 | 俄罗斯品种 |
16 | RS1401 | 全俄瓦维洛夫作物科学研究远东实验站 | 俄罗斯品种 | 俄罗斯品种 |
17 | RS1402 | 全俄瓦维洛夫作物科学研究远东实验站 | 俄罗斯品种 | 欧山杂种 |
18 | RS1403 | 全俄瓦维洛夫作物科学研究远东实验站 | 俄罗斯品种 | 俄罗斯品种 |
19 | RS1404 | 全俄瓦维洛夫作物科学研究远东实验站 | 俄罗斯品种 | 欧山杂种 |
20 | RS1405 | 全俄瓦维洛夫作物科学研究远东实验站 | 俄罗斯品种 | 欧山美杂种 |
21 | RS1406 | 全俄瓦维洛夫作物科学研究远东实验站 | 俄罗斯品种 | 俄罗斯品种 |
22 | RS1407 | 全俄瓦维洛夫作物科学研究远东实验站 | 俄罗斯品种 | 俄罗斯品种 |
23 | RS1408 | 全俄瓦维洛夫作物科学研究远东实验站 | 俄罗斯品种 | 俄罗斯品种 |
24 | RS1409 | 全俄瓦维洛夫作物科学研究远东实验站 | 俄罗斯品种 | 俄罗斯品种 |
25 | RS1410 | 全俄瓦维洛夫作物科学研究远东实验站 | 俄罗斯品种 | 俄罗斯品种 |
26 | RS1509 | 全俄瓦维洛夫作物科学研究远东实验站 | 俄罗斯品种 | 欧山杂种 |
27 | RS1511 | 全俄瓦维洛夫作物科学研究远东实验站 | 俄罗斯品种 | 欧亚种 |
28 | RS1801 | 俄罗斯海参崴 | 俄罗斯野生资源 | 山葡萄 |
29 | RS1802 | 俄罗斯海参崴 | 俄罗斯野生资源 | 山葡萄 |
30 | RS1803 | 俄罗斯海参崴 | 俄罗斯野生资源 | 山葡萄 |
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64 | RS1839 | 俄罗斯海参崴 | 俄罗斯野生资源 | 山葡萄 |
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67 | RS1843 | 俄罗斯海参崴 | 俄罗斯野生资源 | 山葡萄 |
68 | RS1844 | 俄罗斯海参崴 | 俄罗斯野生资源 | 山葡萄 |
69 | RS1845 | 俄罗斯海参崴 | 俄罗斯野生资源 | 山葡萄 |
70 | RS1848 | 俄罗斯海参崴 | 俄罗斯野生资源 | 山葡萄 |
71 | RS1849 | 俄罗斯海参崴 | 俄罗斯野生资源 | 山葡萄 |
72 | RS1850 | 俄罗斯海参崴 | 俄罗斯野生资源 | 山葡萄 |
73 | RS1851 | 俄罗斯海参崴 | 俄罗斯野生资源 | 山葡萄 |
引物名称 | 序列(5'-3') | 退火温 度Tm/℃ |
---|---|---|
VRZAG62 | F:GGTGAAATGGGCACCGAACACACGC R:CCATGTCTCTCCTCAGCTTCTCAGC | 59 |
VVMD27 | F:GTACCAGATCTGAATACATCCGTAAGT R:ACGGGTATAGAGCAAACGGTGT | 63 |
VVMD7 | F:AGAGTTGCGGAGAACAGGAT R:CGAACCTTCACACGCTTGAT | 60 |
VVS2 | F:CAGCCCGTAAATGTATCCATC R:AAATTCAAAATTCTAATTCAACTGG | 63 |
VMC8A7 | F:GCAGCAACTCTCTTACACACCG R:GTGGGAGCACTGGTTGCTTTAG | 63 |
VMC7G3 | F:TTACTAGTGCTGTCCTGCTCCA R:TGCTTCCTCTCTTTCAACTTTCA | 60 |
VMC5G7 | F:CATTTCGCTGGTGACTTTC R:ACTACCCTCTCTTTCTCGC | 60 |
VMC2C10.1 | F:CCATGTTTCTATAGTTCTTCGGC R:GATGTCCATATATTGGGTCCTG | 60 |
VMC8F10 | F:TATGAAAGATGAATGGCTGCTC R:AAGGGTGCTTGAAGGTTTATGT | 60 |
VVIN31 | F:GTTGAATAGTGTCCATGTTGTG R:GGATAGAATCACATTTGTAGCG | 60 |
VMCA12 | F:ATGTAATTACCGGTCATGAGTT R:TTCTTGTTTTGCCTATCTATCC | 59 |
引物名称 | 序列(5'-3') | 退火温 度Tm/℃ |
---|---|---|
VRZAG62 | F:GGTGAAATGGGCACCGAACACACGC R:CCATGTCTCTCCTCAGCTTCTCAGC | 59 |
VVMD27 | F:GTACCAGATCTGAATACATCCGTAAGT R:ACGGGTATAGAGCAAACGGTGT | 63 |
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VMCA12 | F:ATGTAATTACCGGTCATGAGTT R:TTCTTGTTTTGCCTATCTATCC | 59 |
引物名称 | 观察等位基因数(Na) | 有效等位基因数(Ne) | Shannon信息指数(I) | 多态信息含量(PIC) | 观测杂合度 (Ho) | 期望杂合度 (He) | Nei’s遗传多样性指数 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
VRZAG62 | 7.0 | 3.8090 | 1.5871 | 0.7378 | 0.5694 | 0.7426 | 0.7375 |
VVMD27 | 7.0 | 4.4857 | 1.6675 | 0.7770 | 0.5068 | 0.7824 | 0.7771 |
VVMD7 | 4.0 | 2.0878 | 0.9552 | 0.5211 | 0.2192 | 0.5246 | 0.5210 |
VVS2 | 10.0 | 5.2580 | 1.8830 | 0.8098 | 0.6027 | 0.8154 | 0.8098 |
VMC8A7 | 9.0 | 5.2528 | 1.8216 | 0.8097 | 0.9315 | 0.8152 | 0.8096 |
VMC7G3 | 9.0 | 3.8010 | 1.6030 | 0.7323 | 0.6438 | 0.7420 | 0.7369 |
VMC5G7 | 8.0 | 4.0234 | 1.6769 | 0.7514 | 0.4932 | 0.7566 | 0.7515 |
VMC2C10.1 | 7.0 | 3.8297 | 1.4928 | 0.7389 | 0.4521 | 0.7440 | 0.7389 |
VMC8F10 | 7.0 | 3.5170 | 1.4229 | 0.7156 | 0.1667 | 0.7207 | 0.7157 |
VVIN31 | 3.0 | 1.3050 | 0.4678 | 0.2337 | 0.2603 | 0.2353 | 0.2337 |
VMCA12 | 4.0 | 1.3462 | 0.5316 | 0.2571 | 0.2603 | 0.2590 | 0.2572 |
总数 | 75.0 | 38.7156 | |||||
平均 | 6.8182 | 3.5196 | 1.3736 | 0.6440 | 0.4642 | 0.6489 | 0.6444 |
引物名称 | 观察等位基因数(Na) | 有效等位基因数(Ne) | Shannon信息指数(I) | 多态信息含量(PIC) | 观测杂合度 (Ho) | 期望杂合度 (He) | Nei’s遗传多样性指数 |
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VRZAG62 | 7.0 | 3.8090 | 1.5871 | 0.7378 | 0.5694 | 0.7426 | 0.7375 |
VVMD27 | 7.0 | 4.4857 | 1.6675 | 0.7770 | 0.5068 | 0.7824 | 0.7771 |
VVMD7 | 4.0 | 2.0878 | 0.9552 | 0.5211 | 0.2192 | 0.5246 | 0.5210 |
VVS2 | 10.0 | 5.2580 | 1.8830 | 0.8098 | 0.6027 | 0.8154 | 0.8098 |
VMC8A7 | 9.0 | 5.2528 | 1.8216 | 0.8097 | 0.9315 | 0.8152 | 0.8096 |
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VMC5G7 | 8.0 | 4.0234 | 1.6769 | 0.7514 | 0.4932 | 0.7566 | 0.7515 |
VMC2C10.1 | 7.0 | 3.8297 | 1.4928 | 0.7389 | 0.4521 | 0.7440 | 0.7389 |
VMC8F10 | 7.0 | 3.5170 | 1.4229 | 0.7156 | 0.1667 | 0.7207 | 0.7157 |
VVIN31 | 3.0 | 1.3050 | 0.4678 | 0.2337 | 0.2603 | 0.2353 | 0.2337 |
VMCA12 | 4.0 | 1.3462 | 0.5316 | 0.2571 | 0.2603 | 0.2590 | 0.2572 |
总数 | 75.0 | 38.7156 | |||||
平均 | 6.8182 | 3.5196 | 1.3736 | 0.6440 | 0.4642 | 0.6489 | 0.6444 |
基因位点 | 群体内近 交率(Fis) | 整个群体 近交率(Fit) | 群体分 化率(Fst) | 基因流 (Nm) |
---|---|---|---|---|
VRZAG62 | 0.0571 | 0.1654 | 0.1148 | 1.9271 |
VVMD27 | 0.4025 | 0.4989 | 0.1612 | 1.3006 |
VVMD7 | 0.4234 | 0.5693 | 0.2531 | 0.7376 |
VVS2 | 0.1894 | 0.2692 | 0.0984 | 2.2894 |
VMC8A7 | -0.1998 | -0.1473 | 0.0438 | 5.4602 |
VMC7G3 | -0.1894 | 0.0402 | 0.0644 | 3.6314 |
VMC5G7 | 0.1859 | 0.3370 | 0.1855 | 1.0977 |
VMC2C10.1 | 0.2819 | 0.3787 | 0.1348 | 1.6050 |
VMC8F10 | 0.7221 | 0.7420 | 0.0719 | 3.2286 |
VVIN31 | -0.2326 | -0.1380 | 0.0768 | 3.0051 |
VMCA12 | -0.1838 | -0.0668 | 0.0989 | 2.2790 |
平均 | 0.1777 | 0.2750 | 0.1183 | 1.8641 |
基因位点 | 群体内近 交率(Fis) | 整个群体 近交率(Fit) | 群体分 化率(Fst) | 基因流 (Nm) |
---|---|---|---|---|
VRZAG62 | 0.0571 | 0.1654 | 0.1148 | 1.9271 |
VVMD27 | 0.4025 | 0.4989 | 0.1612 | 1.3006 |
VVMD7 | 0.4234 | 0.5693 | 0.2531 | 0.7376 |
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VMC8A7 | -0.1998 | -0.1473 | 0.0438 | 5.4602 |
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VMC2C10.1 | 0.2819 | 0.3787 | 0.1348 | 1.6050 |
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平均 | 0.1777 | 0.2750 | 0.1183 | 1.8641 |
资源名称 | 观察等位 基因数(Na) | 有效等位 基因数(Ne) | Shannon信息 指数(I) | Nei’s遗传多样 性指数(Nei) | 观测杂合度 (Ho) | 期望杂合度 (He) | 固定指数F |
---|---|---|---|---|---|---|---|
山葡萄选育品种 | 2.8182 | 1.9526 | 0.6952 | 0.3951 | 0.3939 | 0.4183 | 0.0028 |
俄罗斯选育葡萄品种 | 5.2727 | 3.3948 | 1.3337 | 0.6721 | 0.5705 | 0.6926 | 0.1512 |
俄罗斯野生葡萄资源 | 5.4545 | 2.9847 | 1.1742 | 0.5786 | 0.4370 | 0.5850 | 0.2448 |
资源名称 | 观察等位 基因数(Na) | 有效等位 基因数(Ne) | Shannon信息 指数(I) | Nei’s遗传多样 性指数(Nei) | 观测杂合度 (Ho) | 期望杂合度 (He) | 固定指数F |
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山葡萄选育品种 | 2.8182 | 1.9526 | 0.6952 | 0.3951 | 0.3939 | 0.4183 | 0.0028 |
俄罗斯选育葡萄品种 | 5.2727 | 3.3948 | 1.3337 | 0.6721 | 0.5705 | 0.6926 | 0.1512 |
俄罗斯野生葡萄资源 | 5.4545 | 2.9847 | 1.1742 | 0.5786 | 0.4370 | 0.5850 | 0.2448 |
山葡萄选 育品种 | 俄罗斯选育 葡萄品种 | 俄罗斯野生 葡萄品种 | |
---|---|---|---|
山葡萄选育品种 | * | 0.5815 | 0.8068 |
俄罗斯选育葡萄品种 | 0.5422 | * | 0.6896 |
俄罗斯野生葡萄品种 | 0.2146 | 0.3716 | * |
山葡萄选 育品种 | 俄罗斯选育 葡萄品种 | 俄罗斯野生 葡萄品种 | |
---|---|---|---|
山葡萄选育品种 | * | 0.5815 | 0.8068 |
俄罗斯选育葡萄品种 | 0.5422 | * | 0.6896 |
俄罗斯野生葡萄品种 | 0.2146 | 0.3716 | * |
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