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基于18S rRNA基因的PCR/DGGE技术研究山羊瘤胃原虫动态变化

王新峰;苏勇;毛胜勇;刘建新;朱伟云;   

  1. 南京农业大学消化道微生物研究室;浙江大学动物科学学院;
  • 出版日期:2008-08-26 发布日期:2008-08-26
  • 基金资助:
    国家自然科学基金(30530560);; IAEA(12665/RO)

  • Published:2008-08-26 Online:2008-08-26

摘要: 应用PCR/DGGE技术对山羊采食前后瘤胃原虫的多样性随时间的变化进行了研究。采食前和采食后1、2、4和8h分别采集瘤胃内容物样品,对瘤胃原虫特异性的18S rRNA基因经PCR扩增、DGGE电泳分析。结果显示,采食前后DGGE图谱由10条左右清晰可辨的谱带组成,图谱上的泳带反映了瘤胃内的优势原虫,泳带数量和位置的复杂性说明了瘤胃原虫的多样性。并对其中两个优势条带切胶测序,基因序列分析分属于毛口目和内毛目。瘤胃原虫区系相似性分析,采食前为90.5%~94.1%;采食后相似性发生改变,且存在个体差异。多样性指数由采食前的0.82逐渐上升到采食后8h的0.90(P>0.05)。DGGE指纹技术有效地反映了不同样品中原虫优势种的组成,并可通过此技术跟踪研究瘤胃原虫区系在不同条件下的动态变化。

关键词: 山羊, 瘤胃原虫, 18S rRNA, PCR/DGGE