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四种黄单胞菌的基因芯片检测方法的建立

龙海;李一农;李芳荣;   

  1. 深圳出入境检验检疫局;深圳市检验检疫科学研究院;
  • 出版日期:2011-01-26 发布日期:2011-01-26
  • 基金资助:
    深圳出入境检验检疫局博士基金项目(SZ2007101)

  • Published:2011-01-26 Online:2011-01-26

摘要: 结合双重PCR和基因芯片技术同时检测和鉴定我国检疫性细菌,包括水稻白叶枯病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzae,Xoo)、水稻细菌性条斑病菌(X.oryzae pv.oryzicola,Xooc)、柑桔溃疡病菌(X.axonopodis pv.citri,Xac)以及严重危害十字花科作物的甘蓝黑腐病菌(Xanthomonas campestris pv.campestris,Xcc)。以铁载体受体(Putative siderophore receptor)基因序列和RNA多聚酶西格玛因子(RNA polymerase sigma factor,rpoD)基因序列为靶标,设计引物和特异性探针能够同时检测这4种重要的病原菌。对17个细菌菌株进行芯片检测,仅4种靶标菌得到阳性结果,证明此方法具有很高的特异性。4种致病菌基因组DNA的检测灵敏度约为3 pg。检测结果表明,建立的基因芯片检测方法特异性强,能实现上述4种黄单胞菌的准确检测和鉴定,具有良好的应用前景。

关键词: 黄单胞菌, 双重PCR, 基因芯片, 检测