三角帆蚌组织蛋白酶L基因的克隆和序列特征与进化分析

三角帆蚌组织蛋白酶L基因的克隆和序列特征与进化分析

白志毅;汪桂玲;李家乐;

上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室;上海高校水产养殖学E-研究院;

出版日期:2011-06-26 发布日期:2011-06-26
基金资助:
“973”计划前期研究专项项目(2009CB126001);;上海市科委地方院校能力建设项目(08390510100);; 国家自然科学基金青年科学基金项目(31001110);; 上海市水产养殖重点学科建设项目(Y1101)

Published:2011-06-26 Online:2011-06-26

摘要/Abstract

摘要： 组织蛋白酶L在多种生理过程中具有重要作用。根据本实验室构建的三角帆蚌(Hyriopsis cummgii)cDNA文库中已标注的EST序列,利用RACE方法克隆了三角帆蚌组织蛋白酶L基因的cDNA全序列(GenBank登录号为HQ610996)。结果表明,该序列全长为1 105 bp,包括24 bp的5′-末端非转录区,1 002 bp的开放阅读框和79 bp的3′-末端非转录区,共编码333个氨基酸,包含1个由20个氨基酸组成的信号肽。推测的三角帆蚌组织蛋白酶L前体肽具有组织蛋白酶前体抑制因子功能结构域,具有组织蛋白酶L家族高度保守结构基序ERFNIN[E-X3-R-X2-(L/V)-F-X3-N-X3-I-X3-N]、GNFD和GCXGG;该蛋白的半胱氨酸类蛋白酶半胱氨酸、组氨酸和天冬氨酸活性位点均高度保守。同源性分析表明,推测的三角帆蚌组织蛋白酶L氨基酸序列与其他贝类高度保守,同源性在60%-74%之间。进化分析显示,三角帆蚌组织蛋白酶L与其他贝类组织蛋白酶L聚为一支,在该支中,三角帆蚌与软体动物淡水螺(R.peregra)的亲缘关系最近。本研究结果为进一步研究三角帆蚌组织蛋白酶L的生理功能提供基础资料。

关键词: 三角帆蚌, 组织蛋白酶L, 基因克隆, 进化分析

白志毅;汪桂玲;李家乐;. 三角帆蚌组织蛋白酶L基因的克隆和序列特征与进化分析[J]. .

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