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内蒙古白绒山羊TSC2基因克隆与表达模式分析

史偈君;杨娇馥;张涛;秦毅;谢鸿云;李树裕;郝喜燕;王志钢;   

  1. 内蒙古大学生命科学学院;同济大学生命科学与技术学院;
  • 出版日期:2012-02-26 发布日期:2012-02-26
  • 基金资助:
    国家自然科学基金项目(31160469);;

  • Published:2012-02-26 Online:2012-02-26

摘要: 旨在克隆内蒙古白绒山羊TSC2基因cDNA并分析其特性及基本表达模式。利用RT-PCR分段克隆TSC2基因cDNA片段并测序,将得到的cDNA各片段核苷酸序列拼接后获得绒山羊TSC2基因编码区全长序列(HQ684023)并进行生物信息学分析。半定量RT-PCR方法检测TSC2基因在不同组织中的表达特异性。结果表明内蒙古白绒山羊TSC2基因cDNA编码区核苷酸序列为5 184 bp,包含了编码1 727个氨基酸残基的全长ORF。核苷酸序列与牛、猪、马、大熊猫、犬、恒河猴、人、小鼠及大鼠的同源性分别为97%、90%、89%、88%、87%、87%、87%、86%和86%。NCBI CDD程序预测该基因编码的蛋白质有一个Tuberin结构域和一个Rap-GAP结构域;Psite程序分析有5个N糖基化位点、2个cAMP和cGMP依赖蛋白激酶磷酸化位点、16个蛋白激酶C磷酸化位点、25个酪蛋白激酶磷酸化位点。PSORT程序预测其定位于胞内体膜。TSC2基因在内蒙古白绒山羊的睾丸、脑、肝脏、肺、乳腺、脾和肾脏等组织中都有表达,mRNA丰度在睾丸中较高,乳腺中较低。

关键词: 内蒙古白绒山羊, TSC2, 表达模式