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hRFT2基因单核苷酸多态性的生物信息学分析

谢云飞;解博红;杨子善;   

  1. 新乡医学院生命科学技术系河南省遗传性疾病与分子靶向药物高校重点实验室培育基地;新乡医学院基础医学院;
  • 出版日期:2012-05-26 发布日期:2012-05-26
  • 基金资助:
    河南省自然科学基金项目(102300410139)

  • Published:2012-05-26 Online:2012-05-26

摘要: 旨在筛选可能与人类疾病有关的hRFT2基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,nsSNPs)和突变位点,从SNP数据库中检索并筛选出395个有效的hRFT2基因SNPs,其中包括30个同义SNPs(synonymous SNPs,sSNPs)和31个非同义SNPs(non-synonymous single nucleotide polymorphisms,nsSNPs)。分别采用SIFT、SNPs3D和PolyPhen-2方法分析nsSNPs引起的氨基酸替换是否可能影响hRFT2的功能。结果表明,5个nsSNPs(rs11477762、rs146302587、rs146492942、rs76947760和rs145431028)可能严重影响hRFT2蛋白的功能,其中rs76947760和rs145431028的影响已得到临床证明,另外3个nsSNPs(rs148387972、rs140391358和rs3746802)也可能对hRFT2有较大的影响。

关键词: 人类核黄素转运蛋白2, 单核苷酸多态性, 氨基酸替换