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香蕉枯萎病菌果胶甲基酯酶基因的克隆与生物信息学分析

董章勇;王振中;   

  1. 仲恺农业工程学院;华南农业大学植物病理生理学研究室;
  • 出版日期:2012-06-26 发布日期:2012-06-26
  • 基金资助:
    国家自然科学基金项目(30671349);;

  • Published:2012-06-26 Online:2012-06-26

摘要: 旨在了解香蕉枯萎病菌(Fusarium oxysporumf.sp.cubense)4号生理小种(FOC4)PME基因序列特征,根据同源物种PME相关序列设计引物,利用PCR和RT-PCR技术,克隆FOC4序列基因和开放阅读框,命名为Foc4Pme。结果表明,所获得的PME基因均含有2个内含子和3个外显子,990 bp的片段,编码329个氨基酸。预测编码蛋白有信号肽,具有1个功能位点,其分子质量和等电点分为34.894 8 kD和9.17,该蛋白为稳定存在的蛋白。该蛋白疏水性最大值为2.022,最小值为-2.156,大部分区域为亲水区。该基因编码的蛋白具有一定保守性,进化上与镰刀菌亲缘关系最近。

关键词: 果胶甲基酯酶, 香蕉枯萎病, 香蕉枯萎病菌, 生物信息学分析