多主棒孢菌调控致病性相关基因CCK1的克隆及生物信息学分析

多主棒孢菌调控致病性相关基因CCK1的克隆及生物信息学分析

刘晓妹;蒲金基;张欣;漆艳香;谢艺贤;张贺;郑服丛;

海南大学环境与植物保护学院;海南大学热带作物种质资源保护与开发利用教育部重点实验室;中国热带农业科学院环境与植物保护研究所;

出版日期:2012-10-26 发布日期:2012-10-26
基金资助:
科技部科技支撑计划项目(2007BAD48B04);;

Published:2012-10-26 Online:2012-10-26

摘要/Abstract

摘要： 采用同源克隆、SEFA-PCR和RT-PCR技术克隆获得了多主棒孢菌(Corynespora cassiicola)CCK1基因的DNA和cDNA。生物信息学分析表明,该基因DNA和cDNA全长分别为2 710 bp和1 065 bp,编码区含4个内含子(长53、54、50和56bp),推测编码354个氨基酸,其分子量约40.98 kD,等电点(pI)6.43。从GenBank搜索相似蛋白和构建进化树发现,CCK1与多个丝状真菌调控致病性相关的PMK1类MAPK蛋白聚为一类,且含1个参与双重磷酸化作用的MAPK蛋白激活域TEY和1个Ser/Thr蛋白激酶保守结构域。推测CCK1基因可能参与调控C.cassiicola菌丝生长、产孢和致病性等。

关键词: 多主棒孢菌, 蛋白激酶, 克隆, 生物学信息

刘晓妹;蒲金基;张欣;漆艳香;谢艺贤;张贺;郑服丛;. 多主棒孢菌调控致病性相关基因CCK1的克隆及生物信息学分析[J]. .

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