]*>","")" /> 多粘类芽孢杆菌SC2 xynD和gluB的克隆及序列分析

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多粘类芽孢杆菌SC2 xynD和gluB的克隆及序列分析

朱辉;丁延芹;田方;姜远茂;杜秉海;   

  1. 山东农业大学生命科学学院;山东农业大学园艺科学与工程学院;
  • 出版日期:2008-08-26 发布日期:2008-08-26
  • 基金资助:
    2007年公益性行业(农业)科研专项经费资助(nyhyzx07-024)

  • Published:2008-08-26 Online:2008-08-26

摘要: β-1,4-木聚糖酶和β-1,3-1,4-葡聚糖酶活性检测结果表明,多粘类芽孢杆菌(Paenibacillus polymyxa)SC2能同时产生β-1,4-木聚糖酶和β-1,3-1,4-葡聚糖酶。以菌株SC2的基因组DNA为模板,通过TAIL-PCR方法克隆到4 807bp的DNA片段。DNAMAN软件分析,该DNA片段包含2个开放阅读框(ORF),ORF1长度为1 908 bp,编码含635个氨基酸、分子量为67.8kD的蛋白;ORF2长度为714 bp,编码含237个氨基酸、分子量为26.8kD的蛋白。BLAST分析结果表明,ORF1与已报道的P.polymyxa ATCC 842的xynD基因相似性为94%,ORF2与P.polymyxaWY110的gluB基因相似性为99%。基因序列的系统发育分析进一步说明,ORF1和ORF2分别为β-1,4-木聚糖酶基因xynD和β-1,3-1,4-葡聚糖酶基因gluB。

关键词: 多粘类芽孢杆菌, β-1, 4-木聚糖酶基因, β-1, 4-葡聚糖酶基因, 克隆, 序列分析