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猪戊型肝炎病毒swCH-GS189株ORF2基因的克隆及序列分析

郝宝成;兰喜;柳纪省;胡永浩;   

  1. 甘肃农业大学动物医学院;中国农业科学院兰州兽医研究所家畜疫病病原生物学国家重点实验室农业部畜禽病毒学重点开放实验室农业部草食动物疫病重点开放实验室;
  • 出版日期:2009-05-26 发布日期:2009-05-26
  • 基金资助:
    中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(BRF070307)

  • Published:2009-05-26 Online:2009-05-26

摘要: 为进行猪戊型肝炎病毒(HEV)ORF2基因特征研究,参照GenBank中已发表的戊型肝炎病毒(HEV)核酸序列,设计了一对扩增HEVORF2基因的引物,利用RT-PCR等方法克隆出了一株猪戊型肝炎病毒甘肃分离株GS189的ORF2基因cDNA片段。序列测定结果表明,swCH-GS189株的ORF2基因长2 025 bp,编码674个氨基酸,与GenBank中公布的其它毒株间的核苷酸序列同源性为79.1%~91.8%,推导的氨基酸序列同源性为89.5%~98.8%。系统发育进化树结果表明,该分离株为基因Ⅳ型。

关键词: 戊型肝炎病毒, ORF2基因, 克隆, 序列分析