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栽培大豆染色体改构复合体基因SNP5的克隆及序列分析

张春宝;尹光;赵洪锟;刘晓东;董英山;   

  1. 吉林省农业科学院大豆研究中心;吉林省农业科学院生物技术研究中心;
  • 出版日期:2010-11-26 发布日期:2010-11-26
  • 基金资助:
    国家转基因重大专项(2008ZX08004-004);; 国家科技部“863”计划项目(2006AA10Z120);; 国家“973”计划前期项目(2007CB116205)

  • Published:2010-11-26 Online:2010-11-26

摘要: 根据大豆耐盐基因表达芯片上提供的表达量下调的EST序列信息,借助了电子克隆方法,根据获得的假定序列设计引物,通过RT-PCR,从栽培大豆克隆了染色体改构复合体SNP5类同源基因。其片段长度为812bp,编码240个氨基酸的多肽,分子重量为27.4kD,等电点pI为5.37。NCBI保守结构域分析表明,其属于SNF5超家族,因此我们将其命名为Gm-SNP5(GenBank登录号:HM068595)。Southern杂交表明,GmSNF5基因在栽培大豆基因中至少有一个拷贝。氨基酸序列及系统进化树分析表明,GmSNF5与其同科的豌豆PsSNF5有较高的同源性,氨基酸序列一致性高达92%。由于其部分EST序列在大豆耐盐芯片中表达量下调,因此推测此基因在功能上与栽培大豆的耐盐性相关。

关键词: 栽培大豆, 染色质改构复合体, SNP5基因, 克隆