棕色棉F3'H-羟化酶基因的克隆与生物信息学分析

棕色棉F3'H-羟化酶基因的克隆与生物信息学分析

梁明炜;刘海峰;肖向文;陆雪莹;李艳红;宋武;鲁春芳;李晓波;

中国科学院新疆理化技术研究所新疆植物资源化学重点实验室;中国彩棉(集团)股份有限公司;

出版日期:2011-11-26 发布日期:2011-11-26
基金资助:
中国科学院新疆理化技术研究所博士启动资金项目,中国科学院“西部之光”人才培养计划项目(RCPY200802);;

Published:2011-11-26 Online:2011-11-26

摘要/Abstract

摘要： 根据葡萄的类黄酮3'-羟化酶(F3'H)基因全长cDNA序列Blast所得棉花的EST序列设计引物,以开花后16 d(DPA16)的新彩棉5号(XC-5)纤维为材料,利用RACE和RT-PCR技术分离得到了2个类黄酮3'-羟化酶基因cDNA序列,此2个序列编码区完全相同,仅在3'UTR区存在片段长短的差异,推测可能是基因转录后加工方式不同所造成。克隆所获得的棉花F3'H基因编码区全长1 533 bp,编码510个氨基酸,氨基酸序列分析预测表明,该基因所编码蛋白含有一个跨膜结构域,是一种分泌蛋白,定位于内质网上,并含有一段与细胞色素P450功能区相匹配的保守功能域;序列比对结果表明,棉花F3'H基因与其他多个物种的F3'H基因在氨基酸序列上有较高的同源性;聚类分析结果表明,棉花F3'H蛋白与双子叶植物大豆的F3'H亲缘关系较为接近,而与单子叶植物高粱等作物则较远。

关键词: 类黄酮3'-羟化酶, 棕色棉, RACE, 序列分析

梁明炜;刘海峰;肖向文;陆雪莹;李艳红;宋武;鲁春芳;李晓波;. 棕色棉F3'H-羟化酶基因的克隆与生物信息学分析[J]. .

[1]	饶紫环, 谢志雄. 一株Olivibacter jilunii 纤维素降解菌株的分离鉴定与降解能力分析[J]. 生物技术通报, 2023, 39(8): 283-290.
[2]	潘国强, 吴思源, 刘璐, 郭惠明, 程红梅, 苏晓峰. 大丽轮枝菌（Verticillim dahliae）突变体库的构建与分析[J]. 生物技术通报, 2023, 39(5): 112-119.
[3]	尤垂淮, 谢津津, 张婷, 崔天真, 孙欣路, 臧守建, 武奕凝, 孙梦瑶, 阙友雄, 苏亚春. 钩吻脂氧合酶基因 GeLOX1 的鉴定及低温胁迫表达分析[J]. 生物技术通报, 2023, 39(11): 318-327.
[4]	林艳丽, 覃建兵, 伍翔, 王岩岩, 潘佑找, 柳忠玉. 虎杖PcMYB1启动子的克隆及其活性分析[J]. 生物技术通报, 2021, 37(5): 48-55.
[5]	姚琼, 全林发, 徐淑, 董易之, 李文景, 池艳艳, 陈炳旭. 叉角厉蝽2个章鱼胺受体的基因克隆及化学农药对其表达的影响[J]. 生物技术通报, 2021, 37(10): 152-152.
[6]	刘欢, 徐玲玲, 李江. 一株分离自铀矿酸性浸出液霉菌的鉴定与碳源代谢分析[J]. 生物技术通报, 2018, 34(4): 208-213.
[7]	杨远潇, 字向东,. 牦牛KISS-1基因的克隆及其在生殖轴的表达[J]. 生物技术通报, 2018, 34(3): 142-149.
[8]	金巧, 刘霞, 甘志凯. 木通红喀木虱线粒体基因组的测定与序列分析[J]. 生物技术通报, 2018, 34(11): 127-135.
[9]	郭亚飞, 王君雅, 郭飞, 倪德江. 茶树1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合成酶基因CsDXS1的克隆与表达分析[J]. 生物技术通报, 2018, 34(1): 144-152.
[10]	黄坤勇,李杉杉,郭强,毛培春,田小霞,孟林. 黄花草木樨MoSOS1基因克隆及表达分析[J]. 生物技术通报, 2017, 33(9): 120-130.
[11]	周东, 刘贞, 刘丽, 许鹏程, 郑银英. 新疆辣椒CMV基因组序列分析与^CP基因多克隆抗体制备[J]. 生物技术通报, 2017, 33(8): 88-94.
[12]	闫鑫甜,黄俊骏,楼晨,葛慧雯,梁卫红. 水稻OsRhoGAP1基因的序列特征及表达特性分析[J]. 生物技术通报, 2017, 33(5): 94-101.
[13]	龚明霞, 周芸伊, 王爱勤, 罗海玲, 何龙飞. 山药Actin基因片段的克隆及表达分析[J]. 生物技术通报, 2016, 32(7): 73-80.
[14]	杨美英,岳胜天,韩红,孙合美,刘晶晶,卢冬雪. 野生大豆根瘤GmGS1γ基因序列分析及原核表达[J]. 生物技术通报, 2016, 32(4): 116-120.
[15]	王海娟,戴雨珂,苏森森,王英,潘渠. 一个融合魏斯氏菌隐蔽质粒的序列分析[J]. 生物技术通报, 2016, 32(4): 217-221.

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