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拟南芥过氧化物酶序列与功能的生物信息学分析

马亭亭;周宜君;高飞;余丽;刘冉;刘楠;隋欣;   

  1. 中央民族大学生命与环境科学学院;
  • 出版日期:2012-02-26 发布日期:2012-02-26
  • 基金资助:
    国家自然科学基金项目(31070361);;

  • Published:2012-02-26 Online:2012-02-26

摘要: 植物过氧化物酶(POD)属于多基因家族,不仅是植物体内清除活性氧自由基的重要酶类之一,而且参与多种生理生化过程,在维系植物生长发育过程中发挥重要的作用。采用生物信息学方法对拟南芥过氧化物酶家族的73个基因编码的蛋白质序列的结构和功能进行了分析,其中包含氨基酸的数量、等电点、跨膜结构域、信号肽、二级结构组成及磷酸化位点等,并用Mega4.0软件构建了去除信号肽前后的系统进化树,旨在了解其结构特征。对已经进行功能研究的成员进行结构分析,以此来揭示结构与功能之间的联系,为植物抵御氧化胁迫方面研究提供理论基础。

关键词: 拟南芥, AtPERs, 生物信息学分析