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哺乳动物抗凝血酶基因的分子特征、微共线性与适应性进化

张国俊;胡利宗;李书粉;宋向凤;   

  1. 新乡医学院;
  • 出版日期:2012-03-26 发布日期:2012-03-26
  • 基金资助:
    河南省教育厅骨干教师资助项目(2009年度)

  • Published:2012-03-26 Online:2012-03-26

摘要: 抗凝血酶(AT)是哺乳动物体内重要的天然抗凝血因子之一,它隶属于丝氨酸蛋白酶抑制物家族,主要参与并调节复杂的血凝过程。基于比较基因组学手段,共挖掘出17个哺乳动物抗凝血酶基因(AT),并剖析了它们的基因结构、微共线性、保守基序、功能结构域、以及系统进化关系。基因结构与微共线分析表明,哺乳动物AT基因具有5-12个外显子,大多数是7个外显子;不同物种AT基因所处区段之间具有较好的共线性。哺乳动物AT蛋白特征分析显示,SERPIN功能结构域与保守基序1、2、3、4、5、8和9存在相互重叠的部分。AT基因进化树揭示基因进化和通常认为的物种进化几乎一致。同时,利用PAML中Codeml的位点特异模型在AT基因中发掘了1个正选择位点328D。

关键词: 哺乳动物, 抗凝血酶, 微共线性, 保守基序, 进化