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牦牛HORMAD1基因的克隆及生物信息学分析

金帅;齐社宁;阎萍;梁春年;郭宪;包鹏甲;裴杰;褚敏;丁学智;刘文博;吴晓云;刘建;   

  1. 兰州大学基础医学院;中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所;甘肃省牦牛繁育工程重点实验室;
  • 出版日期:2012-11-26 发布日期:2012-11-26
  • 基金资助:
    现代农业(肉牛牦牛)产业技术体系专项资金(CARS-38);;

  • Published:2012-11-26 Online:2012-11-26

摘要: 利用分子克隆技术获得了牦牛HORMAD1基因编码区序列,并采用生物信息学方法对该基因及其编码蛋白的基本理化性质、疏水性、信号肽、二级结构等方面进行了预测和分析。结果表明,牦牛HORMAD1基因包含一个长度为1 182 bp的开放阅读框,编码393个氨基酸;其编码蛋白属于亲水性蛋白,无明显的信号肽,含有很多个磷酸化位点。二级结构主要以无规则卷曲和α螺旋为主。HORMAD1基因编码产物氨基酸邻接系统树表明,牦牛HORMAD1与黄牛、马和猪等物种的HORMAD1氨基酸遗传距离较近,具有高度相似性。

关键词: 牦牛, HORMAD1基因, 克隆, 生物信息学分析