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DGGE和RFLP方法分析桑粒肩天牛幼虫肠道微生物多样性

陈金华;王中康;贺闽;殷幼平;   

  1. 重庆大学生物工程学院重庆市真菌杀虫剂工程研究中心基因表达与调控重点实验室;
  • 出版日期:2008-12-26 发布日期:2008-12-26
  • 基金资助:
    重庆市自然科学基金资助(渝科发计字2002-17号)

  • Published:2008-12-26 Online:2008-12-26

摘要: 昆虫是一个复杂的微生态系统,这些微生物对宿主发育,营养物质的消化吸收和防御方面起着重要的作用。利用DGGE和RFLP指纹图谱的方法初步研究桑粒肩天牛幼虫肠道微生态系统。对肠道微生物16S rDNA V3区进行DGGE分离,得到24个不同位置的条带。DGGE图谱亦显示了肠道微生物的季节变化,夏季较冬季菌群丰富。各月DNA样品混合并扩增16S rDNA全长序列,构建16S rDNA克隆文库。用Msp I、Rsa I对文库中175个随机阳性克隆的质粒DNA进行限制性酶切。酶切图谱聚类分析结果显示175个克隆被归为60个不同的类群,这一结果显示桑粒肩天牛幼虫肠道微生物非常丰富。因此,这2种方法都能有效的反应肠道微生物多样性状况,且RFLP比DGGE具有更好的分辨率。结合使用这2种方法,初步反应了桑天牛肠道微生物多样性信息。

关键词: 桑粒肩天牛, DGGE, RFLP, 肠道微生态