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人源H5N1禽流感病毒血凝素分子遗传变异特征分析

张继荣;   

  1. 宁夏医科大学基础学院;
  • 出版日期:2009-11-26 发布日期:2009-11-26
  • 基金资助:
    国家科技部“十一五”平台课题(2006BAD06A01);; 美国NIH、USDA以及加拿大IDRC项目部分资助;; 中国科学院三期创新领域前沿项目(KSCX2-YW-N-063)

  • Published:2009-11-26 Online:2009-11-26

摘要: 从GenBank获取已公布的人及相应国家禽感染的H5N1禽流感病毒HA核酸和蛋白序列,用生物软件Clust-alX1.83和MEGA4.0对HA基因序列和蛋白分析,构建HA核苷酸遗传进化树。结果表明,HA蛋白上再次出现既能与人又能与禽受体特异性结合的QNG;东南亚和东亚人感染毒株亲缘关系密切,西亚、南亚和非洲人感染毒株遗传距离近;进化树组成和HA蛋白关键位点氨基酸的变异,揭示多数国家的人感染的毒株与当地禽感染毒株高度同源,具有地域性特征,部分国家之间存在着病毒扩散现象。

关键词: 禽流感H5N1病毒, 血凝素HA, 遗传, 变异