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番茄LeABI3基因的生物信息学分析

范晶;黄明远;李仲芳;梁梓;伏秦超;雷常安;   

  1. 乐山师范学院化学与生命科学学院;
  • 出版日期:2009-11-26 发布日期:2009-11-26
  • 基金资助:
    四川省教育厅基金(08zb051);; 乐山师范学院科研启动项目(Z0858);; 峨眉山生物多样性保护与利用研究所科研项目(08S04)

  • Published:2009-11-26 Online:2009-11-26

摘要: 对所克隆到的番茄LeABI3基因测序结果进行序列分析,发现得到LeABI3基因的2种转录本。应用生物信息学的方法和工具对LeABI3蛋白质的理化性质、跨膜区域、疏水性/亲水性、二级结构、结构功能域和同源树进行分析,结果表明此蛋白是包含一个保守B3结构功能域的亲水性不稳定蛋白,相对分子量为65.4kD,等电点为6.54,可能存在2个跨膜区域。蛋白质二级结构中的主要构成元件是α-螺旋和不规则卷曲,蛋白质同源分析发现番茄LeABI3和马铃薯vp1-ABI3类蛋白相似度最高,同源性为89%。

关键词: 番茄, LeABI3基因, 生物信息学