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生物信息学对番茄LeNHX1基因的研究

范晶;代娟;胡建平;梁梓;黄明远;   

  1. 乐山师范学院化学与生命科学学院;
  • 出版日期:2009-12-26 发布日期:2009-12-26
  • 基金资助:
    四川省教育厅基金项目(08Zb051);; 乐山师范学院科研项目(Z0858);; 峨眉山生物多样性保护与利用研究所科研项目(08S04)

  • Published:2009-12-26 Online:2009-12-26

摘要: 应用生物信息学的方法和工具对番茄LeNHX1蛋白质的理化性质、跨膜区域、疏水性/亲水性、二级结构、结构功能域、功能分类和同源性进行分析。结果表明此蛋白为疏水性稳定蛋白,包含一个保守的氨氯吡嗪咪结合位点LFFIYVLPPI区域,相对分子量为59.0kD,等电点为6.60,存在10个跨膜区域,蛋白质二级结构中的主要构成元件是α-螺旋和不规则卷曲,功能分类和蛋白质同源性分析表明番茄LeNHX1属于液泡膜Na+/H+反向转运蛋白。

关键词: 生物信息学, 番茄, LeNHX1基因, Na/H反转运蛋白