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基于28S rDNA部分序列的石磺科系统发育研究

陈诚;沈和定;吴文健;魏峦峦;王玲;   

  1. 上海海洋大学水产与生命学院;
  • 出版日期:2010-06-26 发布日期:2010-06-26
  • 基金资助:
    国家自然科学基金项目(30972259);; 上海市教委重点学科项目(J50701)

  • Published:2010-06-26 Online:2010-06-26

摘要: 采用PCR技术对采集自中国大陆沿海5地8个群体石磺的28S rDNA部分序列进行扩增。将测序结果与Gen-Bank中的另外3条石磺科贝类的对应序列一起,以小鼠28S rDNA基因序列进行参照,截取D1、D2、D3区域,拼接后进行比对分析。在获得的689bp的序列中,有76个变异位点,28个简约信息位点,A+T平均含量为30.9%,C+G平均含量为69.0%。以分类关系较近的菊花螺科(Siphonaria alternate)为外群,用NJ、MP、ML和贝叶斯法构建分子系统树。4种方法得到的进化树拓扑结构很相似,得到的结果也与沈和定提出的中国大陆沿海石磺科贝类可划分为Peronia、Platevindex、Onchidium、Paraoncidium4个属的观点基本一致。同时,28S rDNA部分序列的系统分析还显示,4个属中Peronia属与Paraoncidium属亲缘关系较近,Platevindex属与Onchidium属关系比较近。

关键词: 28S rDNA, D区, 石磺, 系统发育