]*>","")" /> 一种石磺科贝类线粒体基因组全序列分析

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一种石磺科贝类线粒体基因组全序列分析

魏峦峦;沈斌;沈和定;陈诚;方磊;吴文健;   

  1. 上海海洋大学水产与生命学院;上海外国语大学附属外国语学校;
  • 出版日期:2010-08-26 发布日期:2010-08-26
  • 基金资助:
    国家自然科学基金项目(30972259);; 上海市教委重点学科项目(J50701)

  • Published:2010-08-26 Online:2010-08-26

摘要: 石磺线粒体基因组全序列对研究石磺科分子系统进化具有重要意义。利用LA-PCR技术对一种石磺Platevin-dexmortoni线粒体基因组全序列进行了测定和分析。结果表明,线粒体基因组序列全长13 991 bp,碱基组成分别为27.27%A、16.78%C、20.23%G、35.72%T;由22个tRNA、2个rRNA、13个蛋白编码基因和25个长度为2-118 bp的非编码区组成。4个蛋白质编码基因和5个tRNA基因从L链编码,其余基因均从H链编码。蛋白质基因的起始密码子,除ND2为GTG以外,均为典型的起始密码子ATN。ND2和Cytb基因使用了不完全终止密码子T,其余基因均使用典型的TAA或TAG。预测了22个tRNA基因的二级结构,发现tRNASer和TrnaAsn缺少DHU臂,tRNASer和tRNAThr的反密码子环上有9个碱基,而不是通常的7个碱基。最长的非编码区含有两个类似于的tRNAGln和tRNAPhy的二级结构。

关键词: 石磺科, Platevindex mortoni, 线粒体基因组, 基因组成, 基因结构, 序列分析