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长白猪×蓝塘猪及其杂种基因组甲基化片段克隆与分析

肖正中;刘小红;王翀;李加琪;莫德林;陈瑶生;   

  1. 华南农业大学动物科学学院;广东韶关学院英东农业科学与工程学院;中山大学生命科学学院;
  • 出版日期:2011-04-26 发布日期:2011-04-26
  • 基金资助:
    国家自然科学基金重点项目(U0731003);;广州市科技攻关重点项目(2008Z1-E121)

  • Published:2011-04-26 Online:2011-04-26

摘要: 应用甲基化敏感扩增多态性(MSAP)技术对6头长白公猪和50头蓝塘母猪及51头长白×蓝塘杂交F1代3个群体基因组DNA胞嘧啶甲基化位点进行检测,旨在克隆和分析父母代猪及其杂种F1代之间基因组DNA共同甲基化片段和差异片段,并找到其同源基因。结果显示,从MSAP条带中分离、克隆得到18条3个群体共同的甲基化片段、10条母代独有的甲基化片段和9条杂交一代独有的甲基化片段,其中有1条3个群体共有的甲基化片段通过EST拼接和电子延伸后在NCBI数据库中找到同源基因,即猪类酪氨酸蛋白激酶Lyn基因(GeneID:LOC100152890,序列号:XM_001926250)。结果表明,长蓝杂交F1代与其父母代之间的基因组甲基化存在异同,为通过MSAP技术克隆猪基因组DNA甲基化片段及寻找其对应的甲基化基因提供可能,也会为将来研究这些甲基化基因表达调控机制奠定基础。

关键词: 猪, DNA, 甲基化, MSAP, 克隆