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苦荞中查尔酮合成酶全长基因的克隆及其序列分析

胡耀辉;王冠;刘凯;于寒松;   

  1. 吉林农业大学食品科学与工程学院;吉林农业大学生命科学学院;吉林农业大学食品科学与工程学院和吉林省农业综合开发办公室;
  • 出版日期:2011-07-26 发布日期:2011-07-26
  • 基金资助:
    国家农业部“948”项目(2008-z27)

  • Published:2011-07-26 Online:2011-07-26

摘要: 选用乌克兰伊琳娜苦荞为试验材料,以从叶片中提取的RNA为模板,应用RACE技术结合CODEHOP引物设计方法成功克隆出苦荞中查尔酮合成酶cDNA序列后,将其序列电子合并其全长后设计基因全长特异性引物。以DNA为模板进行PCR扩增出基因序列。通过生物信息学分析表明,该基因全长为1 906 bp,具有一个463 bp的内含子序列,编码区长度为1 188 bp,编码395个氨基酸。Blastn序列比对发现本试验所获得的CHS基因序列与相近物种Rheum palmatum(登录号:DQ205352.1)的CHS基因同源性达86%。将得到的序列命名为RaCHS并提交GenBank,登录号为HQ434624。应用Clustalxl.81和MEGA4软件构建系统进化树,并进行了同源性分析。

关键词: 苦荞, 查尔酮合成酶, RACE, 内含子, 进化树