利用简并引物克隆黑莓、树莓肌动蛋白基因片段及表达分析

利用简并引物克隆黑莓、树莓肌动蛋白基因片段及表达分析

张春红;王小敏;王鲁北;吴文龙;李维林;

江苏省中国科学院植物研究所;

出版日期:2011-08-26 发布日期:2011-08-26
基金资助:
国家自然科学基金项目(31000753);;江苏省农业科技自主创新基金项目(CX[10]109);; 江苏省科技基础设施建设计划项目(BM2009041,BM2010458)

Published:2011-08-26 Online:2011-08-26

摘要/Abstract

摘要： 采用同源克隆法,利用设计的一对肌动蛋白(actin)基因简并引物,从黑莓、树莓和悬钩子杂种3个悬钩子植物品种均得到一条743 bp的actin cDNA片段,推测编码247个氨基酸。序列比对发现,克隆的actin基因推导的氨基酸序列和其他植物的肌动蛋白氨基酸序列具有高度保守性,经数据库搜索后将来自黑莓和树莓品种的actin cDNA片段在GenBank中登录,登录号分别为HQ439558和HQ439559。不同来源的植物actin蛋白系统进化树的聚类结果表明,树莓和悬钩子杂种亲缘关系较为密切。actin基因在3个悬钩子植物品种不同组织中的RT-PCR分析结果表明,其在检测的不同组织中均有一定程度的表达量,可能都属于组成型表达的肌动蛋白基因。研究结果为利用actin基因作为内参进一步研究黑莓和树莓其他基因的丰度奠定基础。

关键词: 悬钩子, 肌动蛋白基因, 简并引物, 序列分析, 半定量RT-PCR

张春红;王小敏;王鲁北;吴文龙;李维林;. 利用简并引物克隆黑莓、树莓肌动蛋白基因片段及表达分析[J]. .

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