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高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒BJBLZ株序列剖析

刘永宏;赵丽;刘俊峰;王凤龙;刘月焕;   

  1. 塔里木大学动物科学学院新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技重点实验室;北京市农林科学院畜牧兽医研究所;内蒙古农业大学动物科学与医学学院;
  • 出版日期:2011-10-26 发布日期:2011-10-26
  • 基金资助:
    北京市农林科学院青年基金项目(2007020122);;

  • Published:2011-10-26 Online:2011-10-26

摘要: 预测与分析HP-PRRSV BJBLZ株序列特点,为进一步该毒株的研究做准备。利用分子生物学软件及服务器,对HP-PRRSV BJBLZ株全序列及各结构蛋白的生化特性、溶解性和核定位信号等进行了分析,结果显示HP-PRRSV BJBLZ株至少可划分12个非结构蛋白和6个结构蛋白;同源性比较显示GP3和GP5蛋白变异性高,M和N蛋白保守。GP3、GP5和M蛋白糖基化位点与参考株有变化,GP2、GP4和N蛋白糖基化位点与所有参考株一致。服务器预测显示,N蛋白的碱性氨基酸比例明显高于其他蛋白,总平均亲水值明显低于其他蛋白;GP2、GP3和GP4蛋白不稳定,GP5、M和N蛋白稳定。6个结构蛋白预测不溶性概率均占66%以上,GP3不溶性概率最高。可以利用以上一些不同于以往各代表株的特点,为PRRS的诊断和防治进行进一步的研究。

关键词: 高致病性, 猪繁殖与呼吸障碍综合征, 序列分析, BJBLZ株