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东亚三角涡虫Rab蛋白cDNA序列的克隆与生物信息学分析

姚杨;黄原;苏杰;   

  1. 西安医学院附属医院;陕西师范大学生命科学学院;
  • 出版日期:2012-02-26 发布日期:2012-02-26
  • 基金资助:
    国家自然科学基金项目(30670279,30970346)

  • Published:2012-02-26 Online:2012-02-26

摘要: 通过构建东亚三角涡虫(Dujesia japonica)cDNA文库,随机挑选重组阳性克隆进行测序,对部分序列进行引物步移法测序,获得1个三角涡虫新基因——Rab蛋白基因(DjR),涡虫Rab蛋白cDNA全长2 141 bp,开放性阅读框(ORF)621bp,编码206个氨基酸,相对分子量为23.1 kD,等电点6.59,属亲水性蛋白,主要定位于细胞质中,在氨基酸第20和21位之间有信号肽剪切位点。有8个磷酸化位点。含有小G蛋白家族5个保守的鸟苷酸结合区域。同源性比较分析结果表明,其碱基序列与已经报道的其他23个物种的相似性为53%-90%,且符合种属之间的进化关系。

关键词: 三角涡虫, Rab蛋白, cDNA文库, 生物信息学分析