辣椒杂交种纯度鉴定的SSR核心引物筛选

生物技术通报 ›› 2014, Vol. 0 ›› Issue (9): 97-101.

辣椒杂交种纯度鉴定的SSR核心引物筛选

管俊娇,张建华,张惠,马芙蓉,杨晓洪,王江民

云南省农业科学院质量标准与检测技术研究所，昆明 650205

收稿日期:2014-04-10 出版日期:2014-09-15 发布日期:2014-09-07
作者简介:管俊娇，女，硕士，助理研究员，研究方向：DUS测试技术研究；E-mail：guanjunjiao@163.com
基金资助:
云南省农业科学院优秀团队培育项目（YAAS2014YY002）

Screening SSR Core Primers for Pepper Germplasm Hybrid Purity Identification

Guan Junjiao, Zhang Jianhua, Zhang Hui, Ma Furong, Yang Xiaohong, Wang Jiangmin

Ministry of Agriculture/Quanlity Standard and Testing Technology Research Institute，Yunnan Academy of Agriculture Sciences，Kunming 650205

Received:2014-04-10 Published:2014-09-15 Online:2014-09-07

摘要/Abstract

摘要： 旨在确定一套适于辣椒杂交种纯度鉴定的核心SSR引物，利用17对SSR引物对100份已知辣椒（Capsicum）杂交种进行DNA指纹分析。根据多态性和杂合率两个指标，确定Hpms1-214、Es395和Hpms1-5为辣椒杂交种纯度鉴定的首选核心引物，利用这3个引物进行筛选，97个品种（占97%）能够找到具有杂合带型的鉴定引物，确定5个引物Es330、Es363、Epms923、Es120和Es64为辣椒杂交种纯度鉴定的备选核心引物。筛选出14个品种的特异性引物，可进一步筛选每个辣椒杂交种的双亲互补型引物。

关键词: 辣椒, SSR, 杂交种, 纯度鉴定, 核心引物

Abstract: In order to determine a set of SSR core primers fitting for pepper hybrids’ purity identification, 100 pepper（Capsicum）hybrids were analyzed by 17 SSR primers. According to their polymorpism and heterogosite rate, three primers Hpms1-214, Es395 and Hpms1-5 were determined as preferred core primers for pepper hybrid purity identification. Using three preferred core primers, 97 hybrids（accounting for 97%）have heterozygosis band type in at least one primer. Five primers Es330, Es363, Epms923, Es120 and Es64 were determined as candidate core primers for pepper hybrid purity identification. 14 varieties had specific primers within the 100 varieties. Primers with complementary band types were further screened for pepper purity identification.

Key words: Pepper germplasm , SSR , Hybrid , Purity identification, Core primers

管俊娇,张建华,张惠,马芙蓉,杨晓洪,王江民. 辣椒杂交种纯度鉴定的SSR核心引物筛选[J]. 生物技术通报, 2014, 0(9): 97-101.

Guan Junjiao, Zhang Jianhua, Zhang Hui, Ma Furong, Yang Xiaohong, Wang Jiangmin. Screening SSR Core Primers for Pepper Germplasm Hybrid Purity Identification[J]. Biotechnology Bulletin, 2014, 0(9): 97-101.

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