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葡萄乙醇脱氢酶基因Ⅲ的电子克隆及生物信息学分析

武雪;黄晓丽;王喆之;   

  1. 陕西师范大学生命科学学院药用植物资源与天然药物化学教育部重点实验室;
  • 出版日期:2009-05-26 发布日期:2009-05-26

  • Published:2009-05-26 Online:2009-05-26

摘要: 利用电子克隆方法获得葡萄乙醇脱氢酶基因Ⅲ(ADHⅢ),并采用生物信息学方法对该基因编码蛋白从氨基酸组成、理化性质、跨膜结构域、疏水性/亲水性、亚细胞定位、高级结构以及功能域等方面进行了预测和分析。结果表明,葡萄ADHⅢ基因全长1 602 bp,包含1 140 bp的ORF,编码379个氨基酸,该蛋白不具有明显的疏水区域,也无跨膜结构域,α-螺旋和不规则卷曲是其二级结构的主要构件。葡萄ADHⅢ包含有ADH功能域,和其他植物的ADHⅢ在序列组成、高级结构及活性位点等方面均具有高度的相似性。

关键词: 乙醇脱氢酶Ⅲ, 电子克隆, 生物信息学