]*>","")" /> 猪Mitf基因的比较基因组学和进化分析

• 论文 • 上一篇    下一篇

猪Mitf基因的比较基因组学和进化分析

艾华水;胡小芬;周利华;   

  1. 江西农业大学农业部江西省动物生物技术重点实验室;
  • 出版日期:2010-07-26 发布日期:2010-07-26
  • 基金资助:
    江西省自然科学基金项目(0630053,2009GZN0010)

  • Published:2010-07-26 Online:2010-07-26

摘要: Mitf(Microphthalmia-associtated transcription factor)是小眼畸形相关转录因子,在黑色素细胞的发育、分化和功能调节上起着重要作用,同时还参与了其它3种细胞包括肥大细胞、破骨细胞和眼色素上皮细胞的发育和分化。针对猪的Mitf基因,从GenBank核酸数据库和proenseml网站下载4条猪的含有Mitf基因片段的基因组序列与牛、人、鼠3种物种的Mitf基因组序列进行比较基因组分析,结果发现,下载的猪Mitf基因组序列或没有排序,或存在一定错误排列。通过生物信息学和比较基因组分析,将猪Mitf基因的基因组序列进行重新组装,得到由6条有序基因组片段组成的较为完整的Mitf基因组序列,并根据人类Mitf基因的转录本信息推测出5种不同猪Mitf基因的转录本。进化分析表明,在人类、小鼠、猪、牛、马和狗中,猪和牛Mitf基因的进化关系最近,提示做猪基因的生物信息学分析可借鉴牛的基因分析结果。

关键词: 猪, 小眼畸形相关转录因子, 电子重排, 比较基因组学