谷子弯孢菌海藻糖酶基因(ClTRE)及其启动子的克隆和序列分析

谷子弯孢菌海藻糖酶基因(ClTRE)及其启动子的克隆和序列分析

谢夏青;李志勇;马继芳;刘磊;董志平;董金皋;

南京农业大学生命科学学院;河北省农林科学院谷子研究所;河北农业大学生命科学学院;

出版日期:2011-07-26 发布日期:2011-07-26
基金资助:
国家自然科学基金项目(30771354);;河北省自然科学基金项目(C2004000699)

Published:2011-07-26 Online:2011-07-26

摘要/Abstract

摘要： 海藻糖代谢调控真菌生长、发育及致病性,为了进一步研究海藻糖代谢在谷子弯孢病菌中的功能,对海藻糖酶基因及其启动子进行了克隆。根据植物病原真菌海藻糖酶基因的保守序列设计简并引物,扩增得到海藻糖酶基因同源序列。通过RACE技术,首次在谷子弯孢病菌中克隆得到了海藻糖酶基因(ClTRE)全长cDNA序列。序列分析表明,该基因最大开放阅读框为2 037 bp,编码679个氨基酸;二级结构预测表明,该蛋白含约40.48%的α螺旋,12.99%的延伸串,6.5%的β转角,40.03%的不规则卷曲;蛋白保守结构域分析发现其含有海藻糖酶特有的保守位点,与其他植物病原真菌中海藻糖酶基因有51%-86%同源性;利用SignalP3.0软件预测谷子弯孢海藻糖酶蛋白具有信号肽。通过染色体步移技术克隆得到其上游启动子序列,利用TFSEARCH软件分析含有多个与逆境胁迫相关的顺式作用元件,初步推测该基因与逆境胁迫相关。谷子弯孢病菌ClTRE基因及其启动子的克隆,为进一步研究该基因在病菌致病中作用以及以该基因为靶位点的化学防控奠定基础。

关键词: 谷子弯孢病菌, 海藻糖酶, 基因克隆, 染色体步移, 生物信息学

谢夏青;李志勇;马继芳;刘磊;董志平;董金皋;. 谷子弯孢菌海藻糖酶基因(ClTRE)及其启动子的克隆和序列分析[J]. .

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